Nakon što je izgubio pamćenje i jedinu osobu koju je volio, Bourne je prisiljen razotkriti svoju prošlost kako bi mogao imati budućnost. Putujući od Moskve, Pariza, Londona do Tangera i New Yorka, nastavlja potragu za pravim Jasonom Bourneom – cijelo vrijeme nastojeći nadmudriti brojne policajce, savezne časnike i Interpolove agente koji ga drže na nišanu.
Prošlost Jason Bournea vraća se po njega. U drugom dijelu sage o tri filma koja se temelji na životu Jason Bournea, bivšeg CIA-inog agenta koji gubi pamćenje i dok se bori da ga oporavi i otkrije tko je on, našao se uključen u mrežu špijunaže i vladine manipulacije od strane Sjedinjenih Država gdje će ga progoniti profesionalni ubojice, paravojni plaćenici i bivši CIA-ini drugovi. Film započinje u Goi u Indiji, gdje su Jason i Marie otišli živjeti da bi se sakrili od Treadstonea, ali tamo ima bivšu tvrtku agent ih locira i progoni. Jason Bourne započinje svoju avanturu da otkrije svoju prošlost sjećanjem se dijela toga i progoni agenta koji se također predstavlja kao on.
Nakon što joj je nećakinja Tomoko umrla pod nerazjašnjenim okolnostima, novinarka Reiko posjećuje ožalošćenu obitelj i dozna da je smrt djevojke povezana sa smrću njezinih vršnjaka. Istražujući o čemu je riječ, Reiko dođe do zagonetne videovrpce koju je Tomoko odgledala neposredno pred smrt. Pogledavši kratki film s naizgled nepovezanim kadrovima na vrpci, Reiko dobije telefonski poziv koji joj navijesti skoru smrt. Udruživši se s bivšim suprugom Ryujijem, Reiko krene u očajničku borbu s vremenom kako bi razriješila misteriju, ali i spasila život svoga sinčića Yoichija koji je također pogledao zlosretni film...
Filmsku glumicu je ubio muž ljubomoran na njezine mlade prijatelje te je ostavio njeno tijelo na plaži. Pisac Robert Tisdall (D. De Marney) ga je uočio i potrčao u namjeri da pozove policiju, a svjedoci su zaključili da je on ubojica. Robert je uhićen i lažno optužen za glumičino ubojstvo.
Tijekom listopada 1994., tri studenta filma na koledžu u Montgomeryju, Heather Donahue, Joshua Leonard i Michael Williams dali su prijedlog za stvaranje projekta koji će se predstaviti u filmskoj klasi, a projekt nazvan Heather "Projekt vještica iz Blaira" uključivao je intervjue sa stanovnicima grada iz Burkittsville-a, Maryland, o lokalnoj vještici.