قبل ثلاثين عامًا ، وصل الفضائيون إلى الأرض. ليس للغزو أو تقديم المساعدة ، ولكن للبحث عن ملجأ من كوكبهم المحتضر منفصلة عن البشر في منطقة جنوب إفريقيا تسمى المنطقة 9 ، تتم إدارة الأجانب بواسطة شركة Multi-National United ، التي لا تهتم برفاهية الأجانب ولكنها ستفعل أي شيء لإتقان تقنيتهم المتقدمة. عندما يتعاقد الوكيل الميداني للشركة مع فيروس غامض يبدأ في تغيير حمضه النووي ، فهناك مكان واحد فقط يمكنه إخفاءه: المنطقة 9.
تدور الأحداث حول (روحيت) الذي تعرض في صغره لحادث سيارة تسبب في عدم إكتمال نموه بشكل سليم، يحاول (روحيت) استكمال أعمال والده في محاولة للتواصل مع الفضاء الخارجي ليجد نفسه أمام مجموعة من الاكتشافات المذهلة.
تدور احداث الفيلم بعد تضحية الأب الأسطوري بحياته لضمان انتصار البشرية ضد كايجو المتوحش. نشهد ابنه جيك بينتيكوست قد تخلى عن تدريبه منذ ذلك الحين وانخرط بعالم الجريمة. لكن عند ظهور تهديد، يوشك على تدمير مدننا وإخضاع العالم بأسره على ركبتيه، تأتي فرصة جيك الأخيرة للارتقاء إلى إرث والده بمساعدة شقيقته المنعزلة ماكو موري.