Daniel Larusso Los Angelesera iritsi da ekialdeko kostatik, lagun berriak egiteko asmoz. Hala ere, Kobren erasoen jomuga bihurtu da. Karateko ikasle-talde etsai bat da Kobrak, eta taldeko buruzagiaren neska-lagun ohi Alirekin irteten hasi da. Egoera horretan, borroka-arteen maisu bati (Miyagi) laguntza eskatu besterik ez du, karatea erakuts diezaion. Miyagiren babespean, Danielek bere gaitasun fisikoak ez ezik, oztopo guztiak gainditzeko behar duen segurtasuna ere garatuko du.
New Yorken krimen-bolada izugarria pairatzen ari dira. Poliziak ez du susmagarririk eta misteriotsuena zera da: kriminalak ikusezinak dira eta erabat isilak. Ordena mantentzeko gai direna bakarrak Ninja dortoka mutante alai batzuk dira: Donatello, Leonardo, Raphael eta Michelangelo.