Film opowiada o jednym z najbardziej dramatycznych okresów w historii świata: rozmieszczeniu radzieckich rakiet na Kubie w 1962 roku i związanym z tym kryzysem międzynarodowym, którego groźbą był wybuch konfliktu nuklearnego między Rosją a Stanami Zjednoczonymi. Tytułowe 13 dni były najdramatyczniejszym okresem dla administracji Kennedego. W gabinetach rządowych i prezydenckich rozgrywała się walka między doradcami prezydenta, Pentagonem, CIA. Kryzys oglądamy oczami specjalnego asystenta prezydenta Johna F. Kennedego - Kennego O'Dommell'a (K. Costner).
Rok 1939. Czeski dyplomata Jan Masaryk ucieka do Ameryki, aby schować się przed niedawną przeszłością. W USA stara się zapomnieć o osobistej i politycznej zdradzie, którą on i jego kraj ponieśli, ale te wydarzenia kładą się cieniem na każdym jego kroku. Z pomocą dr Steina, emigracyjnego niemieckiego psychiatry i pięknej pisarki Marii Davenport, Masaryk próbuje pokonać swoje demony i ponownie przeżyć dramatyczne wydarzenia, które doprowadziły do wybuchu drugiej wojny światowej.
Neil Shaw (Wesley Snipes) kieruje elitarną jednostką specjalną działającą na zlecenie ONZ. Szefowa służb bezpieczeństwa Eleanor (Anne Archer) decyduje się powierzyć mu zadanie obserwacji ambasadora Chin, Wu (James Hong). Od powodzenia jego śledztwa zależy podpisanie umowy handlowej, która zniesie ostatnie bariery między Chinami a resztą świata... Podczas jednego z wystąpień ambasador zostaje zastrzelony przez ukrytego snajpera. Shaw rusza za nim w pościg. Zostaje jednak ujęty przez policję, która bierze go za zabójcę... Jedynie ucieczka i odnalezienie prawdziwego mordercy może uratować dobre imię Shawa... [opis dystrybutora dvd]