À une époque où les monstres parcourent la Terre, et alors que l’humanité lutte pour son avenir, Godzilla et King Kong, les deux forces les plus puissantes de la nature, entrent en collision dans une bataille spectaculaire inédite. Alors que Monarch se lance dans une mission périlleuse en terrain inconnu, et qu’il découvre des indices sur les origines des Titans, un complot humain menace d’éradiquer ces créatures – qu’elles soient bonnes ou mauvaises – de la surface de la planète.

Carl Denham, un cinéaste en quête de notoriété, prépare un tournage dans les mers du Sud. Il embarque avec toute son équipe à bord du «Venture». Bien que les acteurs soient persuadés de tourner un film d'amour et d'aventures, le réalisateur espère secrètement que le voyage les conduira à Skull Island (l'île du Crâne), une terre inexplorée où, dit-on, les indigènes adorent une créature mystérieuse et terrifiante. Les foules, pense-t-il, se presseront pour découvrir les images qu'il rapportera de son voyage. Ann Darrow, artiste de music-hall au chômage, a été embauchée au dernier moment pour pallier la défection de l'actrice principale.

Le film commence avec les Shinkengers qui battent l' Ayakashi Demebakuto. En assumant sa seconde vie, il capture les Shinkengers dans des miroirs qu'il envoie dans une série de dimensions différentes (tous les genres de films différents) afin de les faire souffrir pour son amusement avant de les tuer. Tout d'abord, les Shinkengers apparaissent dans le jidaigeki "Journal des événements notables", combattant un groupe de samouraïs, suivi peu après par une confrontation occidentale entre Genta et Ginshirō ( 銀 志 郎 ) , le propriétaire du stand de sushi Silver Zushi, dont la nourriture est mieux, dans "Wild Grip". Puis la scène change de nouveau pour le drame policier "Passionate Version" avec les vassaux comme flics pendant que Takeru est pris en otage alors que les Shinkengers commencent à réaliser que quelque chose ne va pas.

Takatora Kureshima visite un ancien site de projet expérimental de la société Yggdrasill situé dans une république frappée par la pauvreté et les conflits. Il visite le site pour la première fois en 8 ans et est subitement attaqué ! Il est dans l'endroit le plus dangereux de la république, dans lequel de nombreux jeunes hommes sont tués pour se défendre en essayant de survivre...