عند احتجاز والدتهما بالمستشفى، أمضت الأختان الصغيرتان الصيف في الريف الياباني بصحبة والدهما.
تقود شُرطية نصف آلية (سايبورج) تدعى ميجور قسم فريق النخبة المعروف بـ(القطاع 9)، يتم توكيلها بمهمة إيقاف المجرمين والمتطرفين الأكثر خطورة على الإطلاق؛ فينخرط (القطاع 9) في مواجهة ضد عدو يستهدف القضاء على التقدم التقني في تكنولوجيا الآليين.
يجمع لقاء مصيري بين شابّ موهوب وفتاة غامضة في "طوكيو" المهجورة التي تسودها الفقاعات وظواهر الجاذبية غير الطبيعية.