Računalniški heker Neo odkrije pretresljivo resnico: življenje, kakršnega pozna, je digitalna simulacija, ki jo vodi zlobna kiber-inteligenca. Pridruži se odporniškemu gibanju, ki se trudi uničiti iluzijo sveta, v katerem so ljudje sužnji.
Nadarjenemu programerju Calebu zmaga na računalniškem tekmovanju prinese srečanje z briljantnim izumiteljem Nathanom v njegovem skrivnostnem laboratoriju sredi divjine. Caleb navdušen spozna, da je Nathan uspel ustvariti prvega robota z umetno inteligenco Avo. Nadobudni mladenič mora preveriti njene sposobnosti, ob analizah in pogovorih pa se nanjo nenadejano naveže, kar zamegli njegovo objektivnost. Toda Nathan nadaljuje s svojimi skrivnimi načrti in Caleb kmalu ne ve več, komu lahko zaupa?
Borci za svobodo Neo, Trinity in Morpheus se še naprej upirajo vojski digitalnih strojev z umetno inteligenco. Da bi preprečili iztrebljenje človeštva, morajo še bolje spoznati Matrico in ključno Neovo vlogo v igri za usodo sveta.
V prihodnosti, kjer bo znanstveni napredek mogoč, ljudje vse vidike svojega življenja zaupajo sofisticiranim robotom, imenovanim Meccas. Čustva so zadnja meja v razvoju strojev. Ko pa napredni robotski otrok z imenom David programira ljubezen, ljudje niso pripravljeni na posledice.
Will Smith nastopa kot detektiv Del Spooner v srhljivki z vrhunsko tehnologijo, ki jo je navdahnila serija novel vizionarskega pisatelja Isaaca Asimova. Leta 2035 so tehnologija in roboti zaupanja vredni deli vsakdana. Da je zaupanje zlorabljeno, uvidi samo en samcat mož, sam, samcat proti vsemu sistemu. Will Smith bo v prihodnosti obračunaval z roboti. Tistimi 'slabimi', ki ne spoštujejo osnovnega zakona robotike. Le ta namreč zapoveduje, da nikoli ne smejo škodovati človeku. Pri tem mu bo pomagala 'dobra mrha', Bridget Moynahan, ki je z obilico barskih izkušenj uspela zapeljati tudi Colina Farrella kot Rekruta!
V zaključku trilogije "Matrica" se Neo (Keanu Reeves), Morpheus (Laurence Fishburne) in Trinity (Carrie-Anne Moss) borijo, da bi zadnje človeško mesto Sion ubranili pred ubijalskimi stroji, ki so si podjarmili in zasužnjili človeštvo.