القصة تتكلم عن ثلاثة طلاب مدرسة ثانوية “يوو” وصديقه المفضل “هارو” وصديقة طفولته “كوتونا” وبسبب احداث معينة يتنقلون بين العام الحقيقي وعالم “ني نو كوني” ويحاولون إتخاذ القرار النهائي لإنقاذ حياة “كوتونا” المتعرضة للخطر .
يكشف الفيلم أسرار أكثر الطيور المثيرة والغامضة خلال لعبة التجسس العالمية، حيث أن (سكيبر، كوالسكي، ريكو وبرايفت) عليهم أن يلتحقوا بمنظمة التجسس الأنيقة نورث ويند، والتي يقودها العميل السري الذي لا يجب البوح باسمه، وذلك من أجل منع دكتور أوكتافيوس براين الشرير من السيطرة على العالم.
تدور احداث الفيلم بعد تضحية الأب الأسطوري بحياته لضمان انتصار البشرية ضد كايجو المتوحش. نشهد ابنه جيك بينتيكوست قد تخلى عن تدريبه منذ ذلك الحين وانخرط بعالم الجريمة. لكن عند ظهور تهديد، يوشك على تدمير مدننا وإخضاع العالم بأسره على ركبتيه، تأتي فرصة جيك الأخيرة للارتقاء إلى إرث والده بمساعدة شقيقته المنعزلة ماكو موري.
(بالتزار بليك) ساحر متمرس يعيش في (مانهاتن)، يحاول أن يتصدى للخطط الشريرة التي يدبرها عدوه اللدود (ماكسيم هورفاث) للسيطرة على العالم، ويستعين بالشاب (ديف ستاتلر) الذي يرى فيه موهبة دفينة، فيدربه الساحر ويعلمه فنون وعلوم السحر كي يصبح مساعده، ويحاولان سويًا الوقوف في وجه قوى الظلام.
كل ما كانت ترغبه (كلارا) هو مفتاح من نوع خاص لتفتح به صندوقًا يحوي هدية قيّمة من والدتها الراحلة. تُهدى كلارا ببكرة خيط ذهبية في حفلة أبيها الروحي السنوية، وبمقدور البكرة أن تقودها إلى المفتاح المطلوب والذي نكتشف أنه قد اختفي في عالم آخر موازي تفعمه الغرابة والغموض. حيث تقابل هناك ثلاث عوالم مختلفة.