Auf dem Pausenhof einer Grundschule steht eine Fundgruben-Box voller verlorener und vergessener Gegenstände, die die Kinder an der Schule jedoch in jeder Pause zum Spielen verwenden. Sobald die Schüler den Pausenhof dann verlassen und zurück in ihre Klassenräume gehen, schlüpft aus der Box ein harmloses Spielzeugmonster, das die über den Hof verstreuten Gegenstände wieder einsammelt, damit die Kinder in der nächsten Pause erneut damit spielen können. Dieser friedliche Kreislauf wird jedoch eines Tages unterbrochen: Denn der fiese Pausenhof-Bully J.J. stiehlt die verlorenen Spielzeuge und bekommt es daraufhin mit dem Monster zu tun, das dem rüpelhaften Jungen eine Lektion erteilen will…

Während die meisten der kleineren Pokémon ein Nickerchen machen, wacht Togepi plötzlich auf. Nachdem es eine Gruppe fliegender Pokémon gesehen hat, findet es sich getrennt vom Rest der seiner Freunde. Pikachu, Bisasam, Schiggy, Bluzuk, Marill und Enton machen sich auf die Suche nach Togepi. Dort treffen sie auf Elekid, der sie zu einer Gruppe von Owei führt. Jedoch einem von ihnen ein Ei und glaubt, dass Togepi ihr fehlender Teil ist. So muss die Bande reisen, um das fehlende Ei zu finden, und einen Sturm ertragen, der Togepi und die Owei wegwehen könnte.