לאחר שהוסר איום המבול הגדול, שטה תיבת נוח בים בחיפושים אחר אדמה. ההרמוניה בין בעלי החיים, שנמצאים בה, מתחילה להיסדק ככל שעוברים הימים בתיבה הצפופה, כשברקע מלאי האוכל, המצומצם ממילא, מתחיל להיגמר.
סיפורם של שני עכברים: ויני, משורר כריזמטי עם פחד במה נוראי, וטיטו, גיטריסט מוכשר ומקסים. כאשר מתחיל המבול הגדול, ולתיבה מותר להכניס רק זכר אחד ונקבה אחת מכל מין, מצליחים ויני וטיטו, בעזרת הרבה מזל, להתגנב לתוך התיבה של נוח. ביחד, הם מנסים למנוע עימותים בין החיות הטורפות לחיות אוכלות העשב, ולהשתמש בכוח המוזיקה כדי לשבור את המתח ולקרב בין כל החיות על התיבה.
דייב ובנו פיני הם יצורים פרוותיים מצחיקים למראה, שלא הוזמנו להצטרף לתיבת נח. כשכל החיות מתחילות להיכנס אליה, הם מנסים להתגנב פנימה, בעזרתן האדיבה של הייזל וליאה, אם וביתה ממשפחת חתולי הבר. הילדים מוצאים שפה משותפת ויוצאים להסתובב בתיבה, ולהביט בבוא המבול מקרוב. מקרוב מדי, מסתבר. כשהמים שוטפים את הארץ התיבה מזדעזעת, ושני הילדים מוצאים עצמם מחוץ לתיבה. בזמן שהוריהם עושים הכל כדי לסובב את התיבה אחורה ולחפש אותם, עוברים הגורים הרפתקת הישרדות סוחפת ומצחיקה בנסיון לחזור לתיבה. הם פוגשים חברים חדשים, חיות נוספות שמצאו עצמן מחוץ לרשימת המוזמנים לתיבה, ומתחמקים מאויבים רשעים ומצרות. בדרך הם לומדים על העולם, על חברות ועל עצמם. כי לפעמים, רק מי שעומד מול סוף העולם, מוצא את מקומו בו.
דארן ארונופסקי ("רקוויאם לחלום", "ברבור שחור") מביים אדפטציה מרהיבה, שאפתנית וגדולה מהחיים לסיפור נח והמבול. ראסל קרואו מגלם את הצדיק כמעט כקנאי דתי עם שליחות שקיבל דרך התגלות הזייתית המבשרת לו על מבול שהולך למחוק את המין האנושי. נח ובני משפחתו מתגייסים לבניית התיבה האדירה שתציל את שאר בעלי החיים מהכחדה ובתמורה מתמודדים עם דילמות מוסריות לא פשוטות.