Une bande de yakusas est sur le point de prendre en otage la fille d'un riche homme d'affaires spécialisé dans le pétrole. Les yakusas demandent de l'aide à Takuma Tsurugi, mercenaire expert en arts martiaux. Celui-ci accepte mais, lorsqu'il s'aperçoit que les yakusas l'arnaquent, il décide de protéger la jeune fille plutôt que de la kidnapper.

Le masseur aveugle Zatoichi se rend dans le village Itakura pour se recueillir sur la tombe d'un homme qu'il a tué dans des circonstances troubles, plusieurs années auparavant. Il est alors accusé à tort du vol de l'or destiné à payer les impôts de la communauté. Obligé de fuir, il trouve comme compagnon d'infortune un vieil ami, le chef yakuza Chuji, également considéré comme complice du forfait. Pour prouver leur innocence, les deux hommes vont devoir se monter rusés et démêler les fils d'une machination complexe où prend part un redoutable et énigmatique personnage, le samouraï Jushiro.

À la fin du XIXe siècle, l’assassinat d’un parrain respecté provoque une guerre de succession entre ses lieutenants. Le nouveau chef élu à la tête de la grande famille s’efforce d’atténuer les rivalités entre « conservateurs » et « modernistes » et de trouver une voie de compromis pour que survive son clan dans la nouvelle société qui s’annonce.

Une histoire de lynchage de yakuza pendant les périodes Edo, Taisho et Showa.

Un Yakusa est trahi et executé par son patron qui vient de sortir de prison. Il reprend alors conscience sous la forme d'un androide invicible. Avec l'assistance de son géniteur, il va alors se venger en massacrant tous les gokudos respensables de sa mort ainsi que les amis qui l'ont trahit.