在遥远的未来，人类生活在地底，不时会遭受地震和崩塌的灾难。 在基哈村生活着少年西蒙和青年卡米那。西蒙性格内向，卡米那的个性和他正相反，但两人的交情却特别好。一天，基哈村的天顶崩塌了，巨大机器人和少女庸子从天而降，和他们一同出现的还有从蓝天撒下的阳光。“果然存在着地面世界！”西蒙、卡米那以及庸子坐上机械人进入隧道，开始向地表进发！ 然而地面世界和他们想象的并不一样，在螺旋王的支配下，那里到处都是兽人。面对压倒性的对手，西蒙和卡米那展开了无畏的挑战……
《新世纪福音战士剧场版：死与新生》（NEON GENESSI EVANGELION：DEATH AND REBIRTH）是《新世纪福音战士》系列的第一部剧场版，于1997年3月上映。这部剧场版由“DEATH篇（死亡篇）”与“REBIRTH篇（新生篇）”两个部分构成。“死亡篇”是以原电视版第1～第24集的内容为基础，重新剪辑、改编的一个约60分钟篇幅的总集篇（电视版的图象为了适应剧场版的需要裁剪成了1.85：1的画面比例）。大约有20分钟新的镜头，其余的仍是原电视版的画面。在“死亡篇”中出现的新镜头是出现在电视版的第21～第24话的导演剪辑版中的。但是，这些新加入的镜头与剧场版衔接得天衣无缝，看不出是后来加入的。 而“新生篇”内容是承接电视版第24集后的内容，是剧场版《AIR/真心为你》的开头30分钟的内容：第十七使徒被消灭后，SEELE向NERV下达命令，要EVA初号机负责执行“人类补完计划”。然而碇元度不认同SEELE的做法，拒绝执行。SEELE认定这是一种叛变的行为，决定把NERV彻底消灭。破晓时分，NERV本部突然遭到来自战略自卫队的袭击，他们对NERV的人员进行了惨无人道的大屠杀。为了保护驾驶员，葛城美里命令把精神崩溃的明日香送上二号机，并放在湖底的深处，自已就亲自去救碇真嗣 。但此时的碇真嗣已经处在精神崩溃的边缘。
经过短暂的和平后，贵族主义在宇宙殖民地的政治界和商界中抬头，当中罗那家族更组成一支私立军队“骨十字先鋒軍”。地球联邦军一直对宇宙民居采取观察态度，并没有加以理会。U.C.0123年，骨十字先鋒軍部队突袭Side 4各宇宙殖民地，与地球联邦军部队交战。地球联邦军的机动战士的性能不及骨十字先鋒軍的机动战士，战争处于一面倒的状态。宇宙殖民地FRONTIER IV的某间大学内正在进行选美比赛，正当裁判宣布谢西莉胜出时，一架被毁的机动战士掉下来，会场顿时陷入恐慌。主角西普克和他的朋友集合后前往战争博物馆避难，但他们眼见地球联邦军节节败退，于是决定驾驶的半毁的旧式机动战士，想逃往24号港口乘搭难民船……
汤姆和杰瑞乘太空飞船到达火星。他们碰见火星居民并得知，火星人要侵略地球，“Invincitron”援助，一个真空挥动的巨型机器人。于是汤姆，杰瑞和他们的火星盟友开始保护地球！
一名叫达尔的走失男孩被小镇人们发现，由于没人认领，他被带到福利院。经过检查，医生发现他身体各项机能正常，而且智商很高，只是失去了一部分的记忆。 达尔被安排暂时居住在安迪家。安迪和妻子乔依斯一直希望能够领养一个孩子，达尔的到来令他们异常兴奋。在相处的过程中，达尔和邻居家的小男孩特塔成为了非常要好的朋友，他们一起上学、一起玩耍、一起为安迪的棒球队赢得了胜利，大家都觉得达尔是个非常聪明而且惹人喜爱的男孩。 忽然有一天，两个自称是达尔父母的人来接走了达尔，这令安迪全家和特塔非常伤心。达尔也对他们产生了深厚的感情，恋恋不舍地离开了安迪家。 事实上达尔是一个在大脑中被植入芯片的机器人，但他现在具备了一个正常孩子的一切生理机能。来接他的也并非他的父母，而是制造他的博士。博士被达尔和安迪他们的深厚情感所感动，他希望达尔能像正常孩子一样生活，但国家的高级官员却要求摧毁达尔。博士在同事的配合下，将达尔带出试验基地，遭到警察的追击，途中博士为了掩护达尔中弹身亡。 达尔潜入空军基地，开着战斗机向安迪家的方向飞去。空军基地地面遥控飞机在飞行过程中自动摧毁，达尔弹出飞机，降落在安迪家旁边的湖中。达尔终于回到了属于他的“家”中。
就读不如归台高中一年级的麻中蓬，某日放学后偶然与自称『怪兽操控者』的谜样男子失马邂逅。此时，一只巨大怪兽突然现身城镇之中，失马随即变身为巨大机器人「DYNAZENON」迎战，麻中蓬与在场的同学们南梦芽、山中历、飞鸟川千濑等人因而被卷入这场激烈战斗之中，众人之后与失马一同组成「失马队」迎战接二连三来袭的怪兽……
人类由于核战争已经湮灭，灰烬上兴起的种族：精灵族，仙女族，矮人族和突变种继续在地球上繁衍生息。仙女族女王生下双胞胎儿子，都是强大的巫师。 Avatar是一个善良的小精灵而Blackwolf是一个邪恶的突变种。