Είναι το 2009μ.Χ. και η ανθρώπινη φυλή βρίσκεται σε έναν πόλεμο μεταξύ γιγάντιων ανθρωποειδών. Επιστρέφοντας από τα πέρατα του ηλιακού μας συστήματος, το διαστημόπλοιο SDF-1 Macross μεταφέρει επιζώντες του νησιού της Νότιας Αταρίας. Η ταινία είναι μια επανάληψη των γεγονότων που της ομώνυμης τηλεοπτικής σειράς του 1982.
Χρόνια μακριά, η γη βρίσκεται σε πόλεμο με την εξωγήινη φυλή των Ντράκον και διεκδικεί την κυριαρχία της στο Διάστημα. Κατά τη διάρκεια μιας μάχης δύο διαστημικά αεροσκάφη συγκρούονται σε έναν άγνωστο πλανήτη. Καθώς η βοήθεια αργεί να έρθει, οι δυο φυλές θα πρέπει να συνεργαστούν για να καταφέρουν να επιβιώσουν.
Ο πρόεδρος, ένας αξιωματικός της Συμμαχίας και μια εξωγήινη βλέπουν το ίδιο όνειρο: Ένας άντρας ισχυρίζεται ότι η Γη πρόκειται να ισοπεδωθεί από ένα πανίσχυρο όπλο. Επιβιβάζονται σε διαστημόπλοιο τελευταίας τεχνολογίας και κατευθύνονται στον πλανήτη Ντάλτρον 7, που ο άγνωστος του ονείρου τους τον αναφέρει κατεστραμμένο.
Ο Μπεν, η Γκουέν και ο Κέβιν συναντούν μια μυστηριώδη ομάδα που προσπαθεί να πουλήσει εξωγήινη νανοτεχνολογία στη μαύρη αγορά. Σύντομα συνειδητοποιούν ότι ο κόσμος μας βρίσκεται μπροστά σε μία τεράστια εξωγήινη απειλή καθώς τα τσιπάκια αρχίζουν ξαφνικά να έρχονται στη ζωή. Όλοι θεωρούν υπεύθυνη για αυτή την κατάσταση την παιδική φίλη της Γκουέν, Έλενα. Όλοι, εκτός από τον Μπεν, ο οποίος καλείται να σώσει τον πλανήτη Γη για ακόμα μία φορά αλλά να «καθαρίσει» το όνομα της Έλενα.
Ο χωροφύλακας Κρισό αγωνίζεται να σώσει τους κατοίκους του Σαν Τροπέζ από μερικούς αλκοολικούς εξωγήινους…
Οι κυβερνητικοί πράκτορες ανακαλύπτουν ότι εξωγήινοι ελέγχουν το μυαλό και το σώμα των κατοίκων μιας μικρής πόλης σαν μαριονέτες. Όμως η κρίση κλιμακώνεται όταν τα πλάσματα αρχίζουν να πολλαπλασιάζονται και να εξαπλώνονται.
Ο John Carter (Antonio Sabato, Jr.), ένας μοναχικός πολεμιστής στο σύγχρονο Aφγανιστάν, τραυματίζεται πολύ βαριά και λίγο πριν πεθάνει, η αμερικανική κυβέρνηση τον επαναφέρει και τον χρησιμοποιεί σαν πειραματόζωο σε ένα άκρως μυστικό πρόγραμμα. Ετσι, εν αγνοία του, τον στέλνει με τηλεμεταφορά, για κάποιο άγνωστο λόγο, στον πλανήτη Άρη-126 στο σύστημα του Άλφα Κενταύρου. Γυμνός, άοπλος και περικυκλωμένος απο επικίνδυνους ντόπιους και θανατηφόρα πλάσματα, πρέπει να δώσει μάχη επιβίωσης με μοναδικό του όπλο τα τεράστια άλματα του, λόγω των συνθηκών βαρύτητας και την ευφυία του...