دنی ارچر (لئوناردو دی کاپریو) قاچاقچی الماس است. سالومون (دیجیمون هانسو) در معدن الماس کار اجباری می کند. فرمانده شورشیان سالومون را دیده است که الماسی بزرگ یافته است و فرزند سالومون را به اسارت گرفته است تا الماس را به دست اورد. مدی (جنیفر کانلی) خبرنگاری است امریکایی که در تلاش است تا موضوعی داغ بیابد. دنی به سالومون کمک می کند تا فرزندش را بیابد، سالومون به دنی کمک می کند تا الماس را بیابد، دنی به مدی کمک می کند تا خبر داغ را تهیه کند. مدی به هر دوی انها کمک می کند تا الماس و کودک را بیابند. فرمانده شورشیان نیز سر راه همه انهاست....
۴ دوست در باغ وحشی در نیویورک زندگی می‌کنند: الکس (شیر)، مارتی (گوره خر)، ملمان (زرافه) و گلوریا (اسب آبی). با گم شدن یکی از آن‌ها بقیه به دنبال او اسیر شده و به طور ناخواسته داخل قفس به آفریقا برگردانده می‌شوند و در همین حین یک اتفاق در دریا آن‌ها را به سمت سواحل ماداگاسکار می‌کشاند. آن‌ها با ورود به دنیای وحش با یک بومی ماداگاسکاری که نوعی میمون است آشنا می‌شوند. سرانجام قهرمان داستان ما با واقعیت‌های مقدر شده طبیعت مواجه می‌شود و…