Ένας χάκερ ανακαλύπτει ότι ο κόσμος γύρω του αποτελεί μια προσομοίωση της πραγματικότητας. Η ανθρωπότητα, εν αγνοία της, συντελεί στον ίδιο της τον αφανισμό, εκτός αν βρεθεί κάποιος να την αφυπνίσει.
Έπειτα από μακελειό στην εκκλησία, τη μέρα του γάμου της, μια γυναίκα πέφτει σε κώμα. Ξυπνά έπειτα από πολλά χρόνια και αρχίζει να αναζητά τον Μπιλ, εκείνον που διέταξε τη σφαγή. Στο δρόμο της στέκονται εμπόδιο μπράβοι και πληρωμένοι δολοφόνοι.
Κίνα, 3ος αιώνας π.Χ.. Ο ισχυρός βασιλιάς του Κιν φιλοδοξεί να υποτάξει τα έξι αντίπαλα βασίλεια και να γίνει αυτοκράτορας μιας ενιαίας χώρας. Πολλοί επιχειρούν να τον δολοφονήσουν. Ένας πολεμιστής εμφανίζεται και ισχυρίζεται ότι σκότωσε τους τρεις πιο επικίνδυνους από τους επίδοξους δολοφόνους, αλλά ο μονάρχης έχει λόγους να αμφισβητεί τα λεγόμενά του.
Στην Κίνα του 19ου αιώνα, ο πολεμιστής Λι Μου Μπάι, κρυφά ερωτευμένος με την αρραβωνιαστικιά ενός νεκρού φίλου του, αναζητά το δράστη της κλοπής ενός μυθικού σπαθιού. Οι υποψίες του στρέφονται στην κόρη του κυβερνήτη, η οποία, θέλοντας να ξεφύγει από τη μοίρα της, έχει εκπαιδευτεί κρυφά στα μυστικά των πολεμικών τεχνών των Σαολίν.
Ιαπωνία, 19ος αιώνας. Ο Zatoichi είναι ένας τυφλός περιηγητής, που κερδίζει τα προς το ζην παίζοντας τυχερά παιχνίδια και κάνοντας μασάζ. Πίσω, όμως, από την ταπεινή του εμφάνιση κρύβεται ένας απόλυτος μετρ του ξίφους με το χάρισμα χτυπημάτων απίστευτης ταχύτητας και σημαδιού που κόβει την ανάσα! Περιπλανώμενος θα ανακαλύψει ένα απομονωμένο χωριό, στο έλεος της συμμορίας του Γκίνζο. Στο δρόμο του θα βρεθεί ένας πιστός φίλος αλλά και δύο γκέισες που θέλουν να εκδικηθούν για το φόνο του πατέρα τους από αδίστακτους κακοποιούς.
Ο επιθεωρητής Wing είναι ένας αφοσιωμένος αστυνομικός που χαίρει τον σεβασμό όλων των συναδέλφων του. Ηγείται μιας ομάδας που αποτελείται από τους καλύτερους ντετέκτιβ, ενώ όλες οι αποστολές τους στέφονται με επιτυχία. Όταν όμως κατά τη διάρκεια μιας ληστείας σε τράπεζα, η ομάδα του πέσει σε ενέδρα και σκοτωθούν όλοι οι άντρες του, ο Wing δεν θα αντέξει τις ενοχές.
O Νίο, ο Μορφέας, και η Τρίνιτυ μας «ξυπνάνε» μέσα στον αφόρητα πραγματικό και σκοτεινό κόσμο του Μάτριξ. Αποστολή του Νίο είναι, να σώσει σε 72 μόλις ώρες την Ζάιον, την τελευταία ελεύθερη πόλη, από ένα στρατό 250.000 φονικών μηχανών που απειλεί να την καταστρέψει. Σε αντίθετη περίπτωση το ανθρώπινο γένος θα εξαφανιστεί από προσώπου Γης. Οι κάτοικοί της ωστόσο, ενθαρρυμένοι από την πεποίθηση του Μορφέα ότι η προφητεία θα εκπληρωθεί και ο πόλεμος με τις μηχανές θα λάβει τέλος, χάρη στον «εκλεκτό» που είναι ο Νίο, εναποθέτουν όλες τις ελπίδες τους σ΄ αυτόν. Ο Νίο όμως, βασανίζεται από τρομακτικούς εφιάλτες που αφορούν τη ζωή της αγαπημένης του Τρίνιτυ.
Ο Τσινγκ και ο Τσενγκ είναι δύο ορφανά αδέλφια που εκπαιδεύονται σε μια μεγάλη και περίφημη σχολή κουνγκ-φου. Όταν όμως ο Τσενγκ δωροδοκείται από μια αντίπαλη σχολή για να συμμετάσχει σε έναν στημένο αγώνα, αποβάλλεται κι ακολουθεί τον δρόμο της παρανομίας. Τα προβλήματα αρχίζουν όταν η αστυνομία συλλαμβάνει τον Τσινγκ, νομίζοντας πως είναι ο αδερφός του, κατηγορώντας τον για ένα έγκλημα που δεν διέπραξε και πλέον θα πρέπει να αγωνιστεί για να αποκαταστήσει τη φήμη της σχολής του, του αδερφού του αλλά και του ονόματός του, προσφέροντας απολαυστικό θέαμα κουνγκ φου, γεμάτο αγωνία και δράση!
Ο Νίο έχει παγιδευτεί στον «Σιδηροδρομικό Σταθμό», μια διάσταση κάπου ανάμεσα στο Μάτριξ και τον πραγματικό κόσμο. Ο Μορφέας, η Τρίνιτι και ο Σέραφ οργανώνουν την επιχείρηση διάσωσής του ζητώντας τη βοήθεια του Μεροβίγγιου. Εντωμεταξύ οι στρατιές των Μηχανών κατευθύνονται προς την Ζάιον, το τελευταίο οχυρό της ανθρώπινης αντίστασης ενάντια στην κυριαρχία τους. Όμως δεν έχουν ακόμη αντιληφθεί πως κάποιος έχει αποκτήσει τον έλεγχο του Μάτριξ με σκοπό να καταστρέψει τα πάντα: ο κύριος Σμιθ! Ενώ η Ζάιον αντιστέκεται σθεναρά στις καταιγιστικές επιθέσεις των Μηχανών, ο Νίο καταδύεται στα άδυτα του Μάτριξ σε μια ύστατη προσπάθεια να έρθει αντιμέτωπος με τον Σμιθ και να ματαιώσει τα σχέδιά του.
Στην χώρα της Σανταλού, ο στρατηγός Μπίσον έχει πιάσει αιχμάλωτους, μαζί και τρεις στρατιώτες. Ο συνταγματάρχης Γουίλιαμ Γκιλ συντάσσει μια ομάδα ειδικών μαχητών και πηγαίνει να τους απελευθερώσει. Μαζί του είναι και η ρεπόρτερ Τσουν Λι που θέλει να εκδικηθεί τον δόλιο στρατηγό και τέσσερις παράνομοι που στρατολογήθηκαν. Ο Μπισόν, όμως, δεν έχει πει την τελευταία του λέξη και πάντα έχει σκοπό να κατακτήσει όλον τον κόσμο.