Erin Gruwell, enseignante novice de 23 ans, a choisi comme premier poste un lycée difficile de Long Beach. Ses élèves l'ignorent superbement et se regroupent en clans, prêts à s'affronter au moindre prétexte. L'ambiance empire au fil des jours, en dépit des efforts sincères et maladroits d'Erin pour prendre en main cette classe d'«irrécupérables». Un incident mineur met finalement le feu aux poudres, donnant du même coup à Erin l'occasion d'ouvrir le dialogue avec les jeunes. Avec tact et humour, en évitant d'instinct le piège du paternalisme, Erin parvient à instaurer avec la classe un vrai rapport de confiance.
Le film se déroule durant l'hiver 1943, dans une France occupée. Julien qui a 12 ans, fils d'une famille bourgeoise, est pensionnaire au petit collège Saint Jean de la Croix, tenu par les pères carmes. Il retrouve le chemin de l'école sans joie après les vacances de Noël, pour le deuxième trimestre. Une rentrée presque comme les autres jusqu'à ce que le père Jean vienne présenter trois nouveaux élèves. L'un d'entre eux, le jeune Jean Bonnet, est le voisin de dortoir de Julien.
1941, dans un village juif d'Europe de l'Est. Schlomo, le fou du village, arrive essoufflé devant le conseil des sages pour leur annoncer une terrible nouvelle : les Allemands tuent et déportent vers des destinations inconnues tous les habitants juifs des shtetls voisins. Le conseil se réunit et après maintes querelles, une idée jaillit de la bouche même du fou : pour échapper aux nazis, ils organiseront un faux train de déportation !
Le 20 janvier 1942, à Wannsee, dans la banlieue de Berlin, des hauts dignitaires nazis, sous la présidence de Reinhard Heydrich, tiennent une réunion secrète. Ces hommes discutent des modalités de l'organisation administrative et logistique de la « solution finale à la question juive », c'est-à-dire la planification de l'exécution systématique de millions de juifs européens dans les centres d'extermination.
Otto Frank est le seul de sa famille à avoir survécu à la déportation. Il revient en pélerinage dans le grenier d'Amsterdam où il s'est cache durant deux ans avec sa famille et découvre le journal où sa fille, Anne, tenait une correspondance avec une amie imaginaire.
En montrant les vestiges existants sur le terrain, Auschwitz Projekt présente la première opération de grande envergure visant l'aménagement territorial de l'Europe de l'Est annexé au Grand Reich. Ici sont réunies toutes les politiques mises en oeuvre par l'État nazi : la politique territoriale, la politique démographique et raciale, la politique concentrationnaire, la politique d'extermination, la politique industrielle, la politique agricole et celle de la recherche scientifique. Auschwitz est en réalité l' « immanence incandescente » du projet hitlérien.
Durant la Seconde Guerre mondiale, en Allemagne. Kurt Gerstein, médecin en poste à l'institut d'hygiène de la Waffen SS, devient le superviseur de l'approvisionnement en gaz Zyklon B des camps de la mort nazis. De passage à Auschwitz, il découvre, horrifié, la terrible réalité des chambres à gaz. Chrétien convaincu, il décide de porter témoignage, de se faire « espion de Dieu » pour alerter la communauté diplomatique internationale. Aidé par un jeune prêtre italien, il tente surtout de prévenir le Vatican, certain alors de pouvoir stopper ces trains qui alimentent chaque jour les camps en milliers de vies humaines. Inlassablement, jour après jour, sans se décourager, au péril de sa vie, Gerstein poursuit son entreprise de dénonciation, accumulant les documents et les preuves matérielles, s'enfonçant dans le double jeu et le désespoir…
Les détenus du camp de Buchenwald, pour certains emprisonnés depuis de nombreuses années par le régime nazi, veulent croire à la fin de la guerre et à l'écroulement du national-socialisme. Regroupés autour de leur chef, Krämer, les plus déterminés ont créé un mouvement de résistance. La découverte d'un petit enfant juif, dissimulé dans une valise, les bouleverse. Vont-ils laisser l'innocent aux mains de ses bourreaux ? Les détenus décident de cacher l'enfant et de le soustraire aux SS. Leur combat redonne un sens à leur vie de prisonniers, parcelle d'espoir dans un univers de terreur...
Nous pensions tout connaître sur l'Holocauste. Ce n'est pas le cas. Avant les camps de la mort, des millions de victimes ont été assassinées par de balles en Europe de l'Est. Personne ne sait combien ont été tuées et les morts n'ont jamais été retrouvés. Aujourd'hui, des équipes d'enquêteurs utilisent des analyses médico-légales et des technologies de pointe pour établir la véritable ampleur de l'Holocauste.
1964. Les allemands ont gagné la Seconde Guerre mondiale. On s'apprête à fêter les soixante-quinze ans du Führer Adolf Hitler, et pour cet événement, le président du dernier pays à ne pas s'être soumis à la domination allemande, les États-Unis, s'apprête à signer un traité de paix, ce qui aurait assis définitivement l'emprise du Troisième Reich sur le monde. Lorsque le Sturmbannführer Xavier March est chargé d'une enquête sur deux morts, anciens hauts dignitaires, et qu'il est stoppé dans son investigation, il flaire le mauvais coup. Aidé de son collègue Max Jaeger et d'une journaliste américaine, Charlie Maguire, il va découvrir la face cachée de l'Allemagne et devenir un homme traqué.