PlayStation® -pelin suosittua tarinaa jatkavassa FINAL FANTASY VII -elokuvassa on kulunut kaksi vuotta Midgarin – saavutetun rauhan uhrausten muistomerkin – raunioitumisesta. Maailma kohtaa kuitenkin pian uuden uhan. Salaperäinen sairaus alkaa levitä nopeasti. Vanhat viholliset lähtevät liikkeelle. Sankariutta erakkoelämään paenneen Cloudin on astuttava taas esiin...
SILENT HILL on autio ja hylätty kaupunki, jota piinaavat synkät ja kauhistuttavat salaisuudet. Kaupunki,josta mieluiten pysyy kaukana, mutta jossa epätoivoisen äidin on pakko käydä tuomitun tyttärensä kanssa. Tytär kärsii mystisestä, hengenvaarallisesta sairaudesta, ja kun hän usein kertoo nähneensä kaupungin painajaisissaan, äiti toivoo löytävänsä tuosta aavemaisesta paikasta jonkin hoitokeinon tai vastauksen. Matkalla kaupunkiin salaperäinen hahmo suistaa heidän autonsa tieltä, ja tytär häviää jäljettömiin. Äiti etsii tytärtään kauhuissaan - onko tytär kokenut saman kohtalon kuin ne hirvittävät tuntemattomat, jotka vaeltavat kaupungissa...
On vuosi 2065 ja maa on hyökkäyksen kohteena. Meteoriitti tuo tullessaan miljoonia ulkoavaruuden valloittajia, jotka uhkaavat tuhota kaiken elämän maapallolta. Ihmiset pakenevat linnoitettuihin kaupunkeihin ja yrittävät puolustautua avaruuden uhkaa vastaan. Nerokas tiedenainen Aki Ross kehittää neuvokkaan suunnitelman, jonka avulla pelastaa ihmiskunta. Akilla vain ei ole paljon aikaa: muukalaiset ovat tartuttaneet häneen kuolettavan taudin. Opettajansa tohtori Sidin ja urhean kapteeni Gray Edwardsin avulla Aki kuitenkin päättää taistella katkeraan loppuun asti.
Antisankariduo Ratchet ja Clank kutsutaan hätiin, kun viheliäinen niljake Puheenjohtaja Drek uhkaa tuhota Solana galaksin jokaikisen planeetan pöllyäväksi avaruustomuksi. Yksin kotiplaneetallaan, kaukana muusta maailmasta varttunut Ratchet on lajinsa viimeinen – toisinaan jopa turhan uhkarohkea ”Lombax” ja taskukokoinen älyrobotti Clank tehokaksikon aivot. Pelastaakseen galaksin hirvittävältä kokonaisia planeettoja hävittävältä joukkotuhoaseelta on Ratchetin ja Clankin lyöttäydyttävä yhteen värikkään Galaksin vartijat –sankarijengin kanssa . Matkan varrella he oppivat lisää sankaruudesta, ystävyydestä ja mikä tärkeintä, omasta itsestään.