“Suzume” kertoo 17-vuotiaan päähenkilön Suzumen kasvutarinan. Suzumen matka alkaa hiljaisesta kaupungista Kyushussa hänen tavatessaan nuoren miehen, joka kertoo etsivänsä ovea. Suzume löytää sään pieksemän oven, joka seisoo pystyssä raunioiden keskellä ikään kuin se olisi ollut suojattuna miltä lie iskeneeltä katastrofilta. Ovi vetää Suzumea puoleensa ja hän kurottaa oven kahvaan… Ovet alkavat aueta yksi toisensa jälkeen ympäri Japania päästäen valloilleen tuhon kaikkien lähellä olevien ylle. Suzumen on suljettavat portit estääkseen katastrofin leviämisen.

Vaikeuksiin joutunut äiti hylkää vauvansa, joka päätyy orpokotiin – tai harmaalla sektorilla puuhastelevien adoptiodiilereiden käsiin. Konniksi kovin kyvyttömät kaupustelijat Sang-hyun ja Dong-soo etsivät sosiaalisesta mediasta pariskuntia, joilla on vaikeuksia ”virallisemman” adoption kanssa. Pariskuntia kierretään tapaamassa vauva kainalossa. Seuraan liittyy lapsensa hylännyt, katuva äiti So-young ja pian myös orpokodista karannut 12-vuotias pojanriiviö. Matkan edetessä erikoinen seurue kiintyy pikkuiseen yhä enemmän.

Tositapahtumiin perustuva draama amerikkalaisesta Betty Mahmoodysta, joka elää onnellisena iranilaissyntyisen miehensä ja viisivuotiaan tyttärensä kanssa. Perhe matkustaa Iraniin tapaamaan miehen sukulaisia ja vierailun on määrä kestää vain kaksi viikkoa. Pian käy ilmi, että miehellä ei ole aikomustakaan palata Amerikkaan. Lopulta äidin ja tyttären ainoaksi vaihtoehdoksi jää pako.