על פי אגדה אורבנית שמתרוצצת לאחרונה בטוקיו, אם תתפרסם בקשה מיוחדת באתר "שאל את הגנב" כנגד אדם מסויים, "גנבי הרפאים של הלבבות" יגנבו את הלב של אותו אדם, יגרמו לו להתחרט על מעשיו ובכך יביאו את הצדק על פשעיו. קאזומה מאקיגאמי הוא גנב בלילות, אבל הוא מתחיל להתחרט על הפשעים שעשה ועל שותפיו לפשע. מכיוון שהוא לא מסוגל להתמודד עמם, הוא שולח בקשה ב"שאל את הגנב".
האגדה שנכתבה לה ביומן מגוללת את סיפורם של שני פוקימונים אגדיים, פאלקיה – אדון המרחב, ודיאלגה – אדון הזמן. יצורים שמעולם לא היו אמורים להפגש, ודרכיהם נפגשו במסלול במקום שבו הזמן והמרחב חוצים זה את זה. המפגש הבלתי צפוי הזה הביא אותם למפגש לחימה ענקי אשר יתרחש בעיר אלאמוס, וכתוצאה מכך – כל העולם שאנו מכירים יהרס לחלוטין. כאשר אש וחבריו מגיעים לעיירת אלאמוס במטרה להתחרות בתחרויות הפוקימון שנערכות שם, הם נתקלים בתופעות טבע בלתי מוסברות. הם מאשימים בתחילה את פוקימון האופל המסתורי בשם דארקאי, וממהרים לתקוף אותו. דארקאי שלוקח על עצמו את תפקיד מגן העיירה מפני הכוחות האגדיים שמעבר לזמן ולמרחב נפגע, וכתוצאה מכך עתידם של אש, חבריו וכל תושבי העיירה נמצא בסכנה. המאבק של פאלקיה ודיאלגה עובר לשטחה של העיר. אש וחבריו מחליטים אז להירתם למשימה ולהציל את המצב.
אי שם במעבדה סודית, מנסה חבורת מדענים ליצור מחומר גנטי שהופק משערה מאובנת של מיו, את הפוקימון האגדי, החזק מכולם מיוטו.אלא הדברים מסתבכים, ובמקום הפוקימון המופלא נוצרת מפלצת הנשבעת לנקום בעולם.כך מוצאים את עצמם אש וחבריו, מעורבים בסידרת הקרבות העולמיים, בהשתתפות חבורה של מאמנים, כל אחד מהם רוצה להיות מאסטר פוקימון.
העלילה מתרחשת שבע שנים לאחר שממשלת ארה"ב השמידה את העיר רקון לאחר שהזומבי הראשון יצא החוצה ממעבדות "אמברלה". הסרט עוקב אחר סגירתו של שדה התעופה בעקבות התפרצותו המחודשת של הוירוס בשדה התעופה ומאבקם של הלוחמים בזמומבים על מנת למנוע את התפשטת הווירוס לשאר חלקי ארה"ב.
הסרט השלישי בסדרת סרטי פוקימון לוקח את אש וחבריו אל העיר גרינפילד השוכנת בהרים, בה הם יפגשו את 'האנון' (הלא נודע) וימצאו עצמם בהרפתקה חדשה ומרתקת. בסרט השלישי בסדרת הסרטים של פוקימון, שנקרא בשם המיוחד "סוד האנון". הסרט סיפר את סיפורם של האנונים (פוקימונים מוזרים בצורת אותיות) שלכדו את מוחה של ילדה קטנה בשם מולי, וכתוצאה מכך דברים משונים מאיימים להשמיד את העולם. הסרט מספר את סיפרה של מולי והפוקימון האגדתי אנטיי (אחד משלושת הכלבים האגדיים), שמטרתו הייתה להגשים את כל משאלותיה של מולי.
הסרט המלא מאחורי סדרת משחקי הפלייסטיישן המצליחה. הסיפור המלא מאחורי היסטוריית משפחת מישימה - לא תרצו לפספס את זה! גילוי עובדות מדהימות על שחקנים שונים! כל שחקן חובב ו/או מקצועי של המשחק יאהב אותו! פעם אחת ולתמיד - הסיפור המלא והברור ביותר!