Cuando una serpiente diabólica despierta, los maestros del ying y el yang deben resolver un misterioso asesinato y proteger sus mundos de una conspiración en la corte.
La historia empieza 14 años después del Casi Tercer Impacto, el gobierno japonés decide desmantelar NERV y arrestar a su personal, durante los 14 años varios miembros de NERV obtienen su libertad y deciden formar una organización llamada WILL-E cuyo supuesto propósito es limpiar los mares, en realidad tratan de detener los planes de la nueva NERV. Ikari Shinji se despierta y ve lo que él provocó, tratando de arreglarlo, sin darse cuenta de lo que provocaría
La astrónoma Madison Kelsey obseva como un enorme asteroide cae en picado hacia la Tierra. Pero como a ella no la toman en serio, porque de momento sólo se puede ver en su ordenador con un programa matemático, acude al ex coronel de las fuerzas aéreas Richard Donovan, para conseguir detenerlo antes de que destruya el planeta.
Es el año 2029, ya todos se les ha inyectado un chip que se utiliza para rastrear los movimientos, los empleos y las membresías políticas de las personas. Greg ayudó a inventarlo, pero ahora está en las montañas viviendo una vida tranquila ... es decir, hasta que se encuentra y se enamora de este adorable y muy joven Danny.