דורה בילתה את רוב חייה בחקירת וגילוי הג'ונגל יחד עם הוריה. אך כל זה לא הכין אותה להרפתקה המסוכנת ביותר עבורה - בית הספר התיכון. בהיותה תמיד חוקרת, דורה מוצאת את עצמה מהר מאוד מובילה חבורה שלמה: הקוף בוטס חברה הטוב, דייגו בן דודה, תושב ג'ונגל מסתורי וכמה בני נוער, להרפתקה מסחררת להציל את הוריה ולפתור את המיסתורין שמאחורי עיר הזהב האבודה.
אחרי אסון התרסקות על כוכב לא ידוע, הטייס מילס מבין במהרה שהוא בעצם ננטש על כדור הארץ... רק לפני 65 מיליון שנים. עתה, עם סיכוי אחרון להינצל, מילס יהיה חייב לחצות טריטוריה מלאה ביצורים פרה היסטורייים מסוכנים במאבק גורלי להישרדותם.