Rachel Lang é uma jovem com estranhos poderes telecinéticos, que não controla na totalidade. A sua má relação com a família levou-a a viver uma vida tímida e retraída. Na escola, a maioria dos colegas ri e faz troça dela... até ao dia em que ela resolver libertar a sua fúria.
No Século 25, Aeon Flux (Charlize Theron) é uma operacional de um grupo de rebeldes que lutam contra um regime totalitário que governa uma sociedade aparentemente perfeita, mas que esconde vários segredos. Aeon será enviada numa missão para assassinar um dos governantes.