Džims Felpss nosūtīts uz Prāgu, kur jāizpilda misija ar mērķi nepieļaut klasificēta materiāla nozagšanu. Viņa sieva Klēra un uzticamais partneris Ītans Hants reiz jau bijuši Felpsa komandas biedri. Diemžēl šoreiz kas noiet greizi, un misija izgāžas, atstājot Ītanu kā vienīgo izdzīvojušo. Aģentūra, kas Džimu nosūtījusi, uzskata Ītanu par nodevēju un patieso vaininieku. Nu Ītanam jāliek lietā netipiskas metodes, lai izdotos atgūt savu slavu.

Mālders un Skallija tiek izsaukti atpakaļ dienestā FIB, kad bijušais mācītājs ziņo par psihiskām vīzijām attiecībā uz kādu nolaupītu aģentu.