Em 2029, numa sociedade altamente computorizada, um dos maiores avanços consiste nuns implantes cerebrais que transformam os seres humanos em ciborgues. Entre estes está uma agente secreta cuja missão é apanhar um perigoso hacker.
No ano 2035, os robots estão programados para viverem em harmonia com os humanos e fazerem parte do seu dia a dia. Quando um brilhante cientistca da U. S. Robotics Corporation aparece morto, o detective de Chicago, Del Spooner (Will Smith) é chamado para a investigação do crime. Auxiliado por uma psicóloga de robots, a Dra. Susan Calvin (Bridget Moynahan), o detective Spooner descobre que o principal suspeito do caso poderá ser um robot. Mas quando Spooner se aproxima da verdade, ele vê-se apanhado numa corrida pela própria vida. Com o tempo a escassear, uma ainda maior ameaça, que desafiará toda a existência humana começa a emergir.
Motoko Kusanagi e os membros da Divisão de Segurança Pública 9 conhecem Takashi Shimamura, que lidera o grupo de refugiados "N". O ano é 2045, quando um ataque pós humano começa nas ruínas de Tóquio, onde a singularidade da evolução se aproxima. O desastre económico que abalou todas as nações e a evolução explosiva da IA mergulharam o mundo numa guerra planeada e sustentável. A fim de impedir os crimes cibernéticos cometidos pelos novos "pós humanos" que surgiram repentinamente na sociedade cibernética, a Seção 9 de Segurança Pública, liderada pela ciborgue protética de corpo inteiro Motoko Kusanagi, dirige-se a Tóquio, que estava em ruínas durante o último guerra. À medida que a ameaça de guerra nuclear devido a um submarino nuclear capturado se aproxima, uma batalha a três entre a Secção 9 de Segurança Pública, a América e os pós humanos intensifica-se.
Thomas Crown, milionário de sucesso, combate o tédio da sua vida com a organização de assaltos a bancos. Vicki Anderson, ambiciosa investigadora de seguros, investiga e chega a Crown. A paixão surge, mas dá-se um jogo de gato-e-rato, onde só o mais astuto pode vencer.
Mais de duas décadas depois de Sarah Connor impedir o Dia do Julgamento, a sua luta recomeça quando percebe que uma nova estirpe de ciborgue foi enviada do futuro pela Skynet – o sistema informático que controla as máquinas e que está determinado a exterminar o que resta da raça humana. Desta vez o objetivo é matar a jovem Dani Ramos, futura líder da Humanidade. Mas a ajudar Sarah nesta luta desigual estará T-800, o ex-exterminador que agora luta ao lado dos bons.
Passaram vinte anos após os acontecimentos de "Matrix Revolutions". Neo leva uma vida aparentemente normal em São Francisco sob a sua identidade original de Thomas A. Anderson e frequenta um terapeuta que lhe prescreve comprimidos azuis para contrariar as estranhas memórias que ocasionalmente o atormentam. Também conhece uma mulher que parece ser Trinity, mas não se reconhecem um ao outro. Quando uma nova versão de Morpheus lhe oferece um comprimido vermelho, a mente de Neo reabre-se ao mundo da Matrix, que se tornou mais segura e perigosa nos anos decorridos desde a infecção Smith, e Neo volta a juntar-se a um grupo de rebeldes para lutar contra um novo inimigo.
No ano 2127 na Base Espacial Minos, um cientista, Dr. Paul Merchant (Bruce Ramsay), sequestra uma nave que ele mesmo havia projetado e é surpreendido por uma equipe de segurança no momento em que está invocando o surgimento do demônio Pinhead (Doug Bradley). O cientista é preso e ao ser interrogado, onde conta a história de sua família e a “herança maldita” que é passada por gerações através da missão de impedir o domínio dos cenobitas entre os homens.