SEELE nem hagyja annyiba a NERV sikereit. Támadást indít a központ ellen. Nem bízzák a véletlenre, ugyanis minden egységüket a központra küldik. Shinji megtörve elbújik a NERV központban a többiek elől. Miután a katonák bejutnak a létesítménybe, kíméletlenül elintéznek mindenkit, akik az útjukba állnak. A feladatuk a három pilóta likvidálása (Shinji, Rei, Asuka). Misato Shinji keresésére indul, de a SEELE beveti a titkos fegyverét, az UNIT 05-ket. Ezek a gépek már pilóták nélkül működnek. Asuka az EVA 02-vel felveszi a harcot ellenük. A feszültség egyre fokozódik, amikor is a harc közepette valami megváltozik. Valami, amit eddig soha nem éreztek. Vajon Misato idejében megtalálja Shinjit, és sikerül-e a NERV-nek visszaverni a támadást? De az egyszer biztos, a döntés ismét Shinji kezébe kerül!

A nyolcvanas évek közepén a szovjetek elhatározzák, hogy megszállják Nyugat-Németországot is. A kansasi Lawrence-ben az emberek békésen élik a mindennapi életüket, ügyet se vetve arra, hogy az atomháború napról napra közelebb kerül hozzájuk. A fokozódó nemzetközi helyzetben az első atomrakétát a szovjetek lövik ki egy német városra, aztán már szépen hullanak a töltetek, kölcsönösen. Az emberek lassan kezdik kirámolni a pincéiket Kansasban, hogy majd esetleg oda rejtőznének. Végül a háromszáznál is több szovjet atomrakéta közül kettő speciel pont a missouri-i Kansas City-t találja el. Sokan azonnal meghalnak, a többieknek pedig föl kell készülniük a radioaktív sugárzás hosszan tartó hatásaira.

David Randall, a kiváló pilóta megbízást kap, hogy kézbesítsen néhány titokzatos fényképet, amelyeket egy tekintélyes csillagász küld egy kollégájának. Doktor Hendron, a címzett, megosztja a pilótával a rettenetes titkot: a Zyra bolygó össze fog ütközni a Földdel és elpusztít rajta minden életet. Dr. Hendron, nagylelkű adományozóktól pénzt kap egy rakéta építésére, amelyen néhány kiválasztott ember - legalábbis elméletileg - át tud repülni a Zyrára, bár nem biztos, hogy a bolygó alkalmas a földi életre. Randall pilóta fogja a rakétát vezetni, aki a végítélet napjának közeledtével egyre jobban belebonyolódik egy szerelmi háromszögbe saját menyasszonya és Hendron professzor leánya között. A rakéta az utolsó pillanatban sikeresen elstartol, de senki nem tudja a fedélzetén, mi várja őket a Zyrán...

1959-ben, egy iskolai avatóünnepségén elteszik a gyerekek elképzelt jövőt ábrázoló rajzait. Van köztük egy, amelyik nem rajzot, hanem véletlenszerűnek tűnő számsorokat tartalmaz. Ötven évvel később diákok elemzik a gyermekrajzokat. A kislány által írt számok Calebhez kerülnek, aki megmutatja azt az apjának, a híres asztrofizikusnak. John Koestler megdöbbenve fedezi fel, hogy a számok dátumokat jelentenek, amelyek a világot sújtó nagy katasztrófák időpontját jelzik. A számsort összeállító kislány lánya, Diana segítségével, Koestler versenyt fut az idővel, hogy megakadályozza a végső katasztrófát.

A sztori karácsony környékén játszódik. A föld felé egy üstökös közeledik, ezt megünnepelvén a világ minden pontján Az üstökös éjszakája címmel partikat szerveznek, mindenki az utcákon tolong, nehogy lemaradjanak a nagy eseményről, a buli jól sikerül, ugyanis mindenki porrá változik. Regina, aki az éjszakát barátjával egy mozi vetítőtermében hancúrozta át, egyike a néhány szerencsés túlélőknek. Barátját nem sokkal ezután egy zombie falja fel.

Jackson Curtis író a Yellowstone Nemzeti Parkban kirándul a gyerekeivel, amikor váratlanul katonák jelennek meg, és egy titkos laboratóriumba szállítják őket. A férfi rájön, a kormány elhallgatta, hogy közeleg a világvége. A maja prófécia szerint az apokalipszis 2012-ben következik be. A világ vezetői titkos tervet készítettek a kiválasztottak túlélésére. Természeti katasztrófák sora sújtja a bolygót: vulkánkitörés, földrengés, szökőár pusztít mindenfelé. Jackson kétségbeesett versenyfutásba kezd az idővel, hogy megmentse a családját, egyik vészhelyzetből a másikba kerülnek. A titkos terv a Himalája csúcsai közé vezeti őket.

Klaatu a világűr mélyéről érkezett a Földre, űrhajójával a Central Parkban száll le. Különös tervvel áll elő, mellyel meghökkenti és elborzasztja a világot. Szerinte a bolygónk rendkívül rossz állapotban van. Ezért mindent elpusztít, hogy azután majd a most élő fajok klónjaival újra benépesítse a Földet. Az egyetlen probléma, hogy az embernek nincs helye ebben a világban, ugyanis őket tartja felelősnek a jelenlegi katasztrofális állapotáért. Klaatu robotjai hamarosan működésbe lépnek, senki sem képes megállítani a jó szándékú pusztítást. Senki, hacsak nem Helen.

Hét év telt el a Donnie Darko történet óta. A családban legkisebb Samantha (Daveigh Chase) 18 éves lett, felnőtt. Úgy dönt, hogy legjobb barátnőjével, Cory-val (Briana Evigan) útra kel, és meg sem áll az Los Angeles-ig, hogy ott kezdjen új életet és táncolással foglalkozzon. Ezek azonban csupán tervek és álmok maradnak, a hosszú úton ugyanis különös dolgok történnek.

Dr. Alan Green, egy amerikai régész Danielle Noblet és az ő búvár csapatát egy expedícióra vezeti ősi Maja fejegyzések felkutatása miatt. A dicsőség helyett a Poklot találják meg, ami Xibalba vízalatti barlangjaiban rejtőzik.