Lahjakkaan nuorukaisen ja salaperäisen tytön polut kohtaavat kuplien ja painovoiman poikkeavuuksien runtelemassa Tokiossa.
Robert Wisen kliinisellä tarkkuudella ohjaama Andromeda uhkaa on vakuuttava kuvaus maapallon ensimmäisestä biologisesta kriisistä. Kun harhateille joutunut satelliitti törmää maahan lähellä syrjäistä kylää New Mexicossa, pelastustiimi saa selville, että kaikki kaupunkilaiset ovat joutuneet hirvittävän kuoleman uhreiksi lapsen ja vanhan kodittoman miehen salaperäistä poikkeusta lukuun ottamatta. Eloonjääneet tuodaan huippumoderniin maanalaiseen laboratorioon, jossa hämmentyneet tutkijat kamppailevat aikaa vastaan selvittääkseen tappavan, toiselta planeetalta olevan viruksen luonteen, ennen kuin se kylvää maailmanlaajuista tuhoa. Erikoistehosteiden ja kekseliäiden lavasteiden saralla uraauurtava Andromeda uhkaa perustuu Michael Crichtonin bestseller-romaaniin, joka aiheutti kansallista vainoharhaisuutta aiheen ajankohtaisuudella ensimmäisen kuuhun laskeutumisen ollessa tuoreessa muistissa. Kyseessä on ehkä kaikkien aikojen hyytävin realistinen scif-trilleri.
Zac Hobson herää kello 6:12 aamulla ja laittautuu valmiiksi työpäivää varten. Ulkona häntä kohtaa omituinen hiljaisuus. Kaikki ihmiset ovat hävinneet. Hylätyt autot tukkivat teitä, taloista löytyy kesken jääneitä ruokia, tyhjät lentokoneet ovat tippuneet taivaalta. Työpaikallaan tutkimuskeskuksessa Zac löytää ainoan ruumiin: hänen entisen työtoverinsa, joka oli mukana uraauurtavassa tiedeprojektissa. Päiviä kuluu, mutta ihmisiä tai eläimiä ei näy . Radiokin on hiljainen. Zac yrittää etsiä kuukausitolkulla merkkejä elävästä elämästä, kuitenkaan sitä löytämättä. Hän asuu isossa aatelistalossa, tekee itsestään kuninkaan, kärsii suuruudenhulluudesta ja hylkää jumalan. Mutta juuri kun hän on sopeutunut yksineloon, kokee hän elämänsä shokin - hän ei olekaan yksin!
Ray Ferrier on New Jerseyssä asuva tavallinen satamatyöläinen. Hänen elämänsä ei ole parhaassa mahdollisessa jamassa. Takana on avioero, nyt jo uudelle miehelleen lasta odottavasta vaimosta, joka kuitenkin pyrkii edelleen kontrolloimaan Rayn elämää. Ray on myös pahasti vieraantunut omista lapsistaan. Teini-ikäinen poika Robbie halveksii isäänsä avoimesti, ja juuri toiselle kymmenelle päässyt tytär Rachelkin hakee mieluummin turvaa äidistään. Kaikkien elämän muuttaa surrealistisen epätodellinen tapahtuma; kaupungissa haukotaan ihastuksesta henkeä, kun lähistölle singahtaa tulipallo. Avaruusolioiden hätkähdyttävän julma hyökkäys Maan asukkaiden kimppuun on alkanut. Tuhannet avaruusalukset alkavat terrorisoida maapalloa, ja tiedemiehet miettivät päänsä puhki suunnitellessaan vastaiskua. Viikonlopuksi Rayn luokse tulleiden lasten turvallisuus on nyt hänen vastuullaan ja Rayn on paettava perheineen henkensä edestä turvaan, hyökkääjien vainotessa kaikkia ihmisiä.
Valmistaudu jännitykseen, jatkuvaan toimintaan ja hurjiin erikoistehosteisiin, kun raivoava tulivuori lennättää loputtoman laavasuihkun järkyttyneen Los Angelesin ylle.
Yhdysvaltain hallitus saa varoituksen uhkaavasta maailmanlopusta, kun tutkija havaitsee auringon epätavallisten voimakkaiden purkausten saavan maapallon ytimen kuumenemaan. Myös kirjailija Jackson Curtis saa tietää maapalloa uhkaavasta tuhosta. Maailman johtajien yrittäessä kaikessa hiljaisuudessa saattaa turvaan harvojen ja valittujen joukkoa, Curtis tekee kaikkensa pelastaakseen oman perheensä.
Geofyysikko tohtori Josh Keyes on saanut selville kauhistuttavan tosiasian: maan keskipiste on lakannut pyörimästä. Planeetan magneettikenttä heikenee ja vain muutamassa kuukaudessa Maa tuhoutuu. On kuitenkin olemassa toivonkipinä: tohtori Keyesin ja huippuasiantunttijajoukon lähettäminen maanalaiselle aluksella planeetan keskipisteeseen. Koska ihmiskunnan kohtalo on hiuskarvan varassa, tiedemiesten ja aluksen miehistön on tehtävä jotain ennennäkemätöntä - heidän on räjäytettävä ydinlataus saadakseen Maan ytimen taas toimimaan.