החטיפה של דה-סו התרחשה מול ביתו, שם הוא חי עד אותו יום בשלווה עם אשתו ובתו האהובה. הוא מוצא את עצמו בבית לא מוכר, במין כלא, ולומד מן הטלוויזיה שאשתו נרצחה באכזריות ושהוא חשוד ברצח. הוא מבלה חמש-עשרה שנים בחדר חשוך, מנסה לברוח ולהתאבד, אך לשווא. יום אחד, לפתע, הוא מוצא את עצמו חופשי. מאותו רגע ואילך דה-סו נחוש בדעתו לנקום באדם שעשה לו את הדבר הנורא הזה. בעזרת מידו הצעירה הוא מוצא אותו, אבל האדם משכנע אותו בהדרגה שאולי נעשה כאן צדק. הדרמה האפלה שנפרשת לפנינו היא מקורית, מורכבת ומהפנטת. המתח והמסתורין מגיעים לשיא במערכת היחסים בין דה-סו ומידו.
בשנת 1926, טניה וגדוד הקוסמים האווירי 203 מכניעים סופית את הרפובליקה וחוזרים הביתה. אך לפתע נקלעת לאוזניהם השמועה על גיוס בקנה מידה רחב של צבא הפדרציה הרוסית. לכן אין ברירה – האימפריה חייבת להתכונן לעוד מלחמה מתישה ואכזרית, אבל הפעם זה לא יהיה קל – בעלות הברית משתפות פעולה עם הפדרציה הרוסית, וכידוע – כשיש אויב משותף, הסיכוי היחיד הוא להתאחד. את צבא בעלות הברית מלווה ילדה קטנה בשם מרי סו – ילדה שנשבעה לנקום את נקמת אביה שנרצח במלחמה נגד האימפריה, על מנת להחזיר את השלום והצדק לעולם.
יצירת מופת מאויירת להפליא ועמוסה בקטעי פעולה שכתב מאמורו אושיי (Ghost in the Shell, Avalon) וביים הירויוקי הוקייורה (אנימטור בכיר ב- Akira). יפן של שנות ה-50, האלימות גוברת ברחוב ובמשטרה. לוחם יחידה מובחרת לא מצליח למנוע פיגוע התאבדות של מחבלת, ומאחר שפניה נותרים חקוקים במוחו הוא יוצא למסע חיפושים אחר דמותה. כשהוא פוגש את אחותה הם נקלעים למאבק שמתחולל בין הטרור הבלתי מתפשר לבין יחידות המשטרה האלימות.
בקיץ גורלי אחד, חבורת ילדים בבית דירות נתוש נסחפת אל האוקיינוס. בלית ברירה הם נאלצים לדאוג לעצמם ולגייס את הכוחות והתושייה למצוא את הדרך חזרה הביתה.
שנה חלפה מאז אירועי ה-"אפס רקוויאם ", תוכנית הקיסר ללוש וי בריטניה שנוסחה כדי לסיים את הסכסוך עם מותו, ו-נאנלי וי בריטניה שולט בריטניה תוך שהוא נעזר בשומר הראש שלה סוזאקו קורורוגי, שלקח את זהותו של אפס. נונאלי וסוזאקו נמצאים בעיצומו של ביקור רצון טוב באומה מדברית כאשר הם מארבים על ידי חוליית נייטמר; סוזאקו מובס בקלות והם נחטפים. השניים מוצאים את עצמם בחזקתם של שליו ושמנה, שליטי האחים של ממלכת זילכיסטן שסבלה מהשלום השלום העולמי שמשתק את יצואם העיקרי: חיילי שכיר חרב. שמנה מסביר את התוכנית שלהם להשתמש ב- נאנלי כדי לגשת לחוסר ההכרה הקולקטיבי בעולם הסי כדי להחזיר את כוחה הפוליטי של זיקלסטאן.
שנתיים אחרי שקלאוד וחבריו הצילו את העולם מידיו של ספירות', אזרחי הכוכב מתחילים לסבול ממחלה מוזרה, שנקראת "סיקון שוקוגון", או "גאוסטיגמה". הם מאמינים שהסיבה למחלה היא הגופות שנלחמו איתם והוחדרו אליהם שנתיים מוקדם יותר, בסוף "פיינל פנטזי 7". האשמה בליבו ורדוף מעברו, החייל לשעבר קלאוד סטרייפ מחליט לעזוב, להתבודד, ולחיות את חייו רחוק מכל חבריו, כאשר הוא ממשיך ב"שירות המשלוחים של סטרייפ", שהמטה שלה נמצא בר של טיפה לוקהארט, "גן העדן השביעי". הבר של טיפה משרת כבית יתומים לילדים שנגועים במחלה "גאוסטיגמה". טיפה שומרת על ביתו בת ה-6 של בארט, מרלין, כאשר הוא סורק את הפלנטה בכדי למצוא אנרגיה חלופית, במקום מאקו. יום אחד קלאוד מקבל טלפון מנשיא שינרה לשעבר, רופוס, המבקש ממנו עזרה והגנה מאדם מסתורי בשם קאדג'. בנתיים קאדג' ושני אחיו לוז ויאזו מחפשים אחרי "אימם", ג'נובה, והם מאמינים שקלאוד יודע איפה למצוא אותה, והם בדרך אליו. באותו זמן ווינסט משוטט בכוכב ואוסף חומר על קאדג' ותוכניתו, וקלאוד וחבריו חייבים להתאחד שוב בכדי להלחם באוייבים החדשים.
יפן, 1966. סאייה היא חלק מקבוצה סודית להשמדת שדים. היא נשלחת בחשאי בתור סטודנטית לבסיס האוויר יוקוטה אשר בפאסה-שי, טוקיו, קצת לפני ליל כל-הקדושים. היא מגלה ששניים מחבריה לכיתה הם ערפדים במסווה בדיוק כשהם מתכננים לתקוף את אחות ביה"ס; בינתיים, עמיתה מגלה עוד ערפד שמתחזה לברמן באיזור "החלונות האדומים" המקומי. וכתוצאה מכך, מתרחש קרב מרהיב-עין.