Când capsula de salvare a lui Ripley este găsită de un echipaj de recuperare, la 50 de ani mai târziu, ea constată că terraformatorii se află pe planeta pe care au găsit speciile extraterestre. Când compania trimite o familie de coloniști pentru a investiga povestea ei, toate legăturile se pierd cu planeta și coloniștii. Compania îi angajează pe Ripley și pe pușcașii marini coloniști să se întoarcă și să caute răspunsuri.

Filmul incepe cu o serie de teste nucleare facute de Franta in Oceanul Pacific, la care privesc cateva iguane marine. Apoi, in prezent, un vas de pescuit japonez este atacat de un monstru marin nemaiintalnit, si un singur om supravietuieste. Traumatizat, este apoi luat la intrebari pe un pat de spital de un francez misterios si la orice intrebare adresata, pescarul repeta tot timpul un singur cuvant -"Gojira". Omul de stiinta Niko "Nick" Tatopolous este chemat sa investigheze niste urme ale unui animal urias, si ajunge repede la concluzia ca sunt facute de o iguana gigant, ce este rezultatul radiatiilor din exploziile nucleare. Godzilla, numele americanizat, isi urmeaza calea spre Nord, ajunge in Manhattan si incepe sa faca ravagii. Chiar si armata anericana isi uneste fortele pentru a distruge Godzilla cu orice pret, dar va fi vreodata deajuns pentru a salva populatia New York?