Tokyo, 2029. Le reti telematiche controllano tutti i meccanismi economici e di produzione, i creatori di software sono una delle risorse indispensabili delle grandi potenze mondiali, e gli Hackers informatici rappresentano una risorsa fondamentale per le grandi organizzazioni criminali, adattatesi alla rivoluzione digitale che ha invaso il mondo. In questo mondo, i cyborgs sono stati in grado di infrangere i limiti degli esseri umani e si sono imposti, grazie ai loro impianti bionici, in ogni settore della vita quotidiana, superiori a semplici androidi, perchè mantengono ancora l'essenza (lo spirito) della razza umana.

In una Tokyo deserta e invasa da bolle e anomalie gravitazionali, il destino fa incontrare un ragazzo di talento e una ragazza misteriosa.

Ebisuzawa Kurumi, Takeya Yuki, Wakasa Yuri e Naoki Miki frequentano tutti la stessa scuola superiore. Vivono anche nel campus della scuola. Le ragazze si divertono a scuola finché gli studenti non vengono infettati da un virus e si trasformano in zombi. Le ragazze sono circondate da studenti zombi e lottano disperatamente per sopravvivere.

Zoey Miller, una laureata in informatica super intelligente e disinteressata all'amore romantico, ha la vita sconvolta quando Zack, la stella del calcio della scuola, soffre di amnesia e scambia Zoey per la sua ragazza.

Nello special troviamo un Lupin in giacchetta nera alle prese con il "Tradimento di Jigen". Jigen infatti sta cercando di far fuori Lupin e Goemon, infuriato, non gli perdona il voltafaccia. Assistiamo a una resa dei conti tra Jigen (considerato "il più temibile rivale di sempre"), Lupin e Goemon.

Richard Clark è un insegnante di mezz'età, che si trasferisce da un prestigioso liceo alla scuola pubblica "Marion Barry", una scuola degradata dove violenza, furti, scontri fra bande e totale assenza di insegnamento da parte dei professori sono all'ordine del giorno. Richard, convinto che la situazione sia risolvibile dimostrando comprensione e interesse verso i ragazzi, trova supporto nella bella collega Victoria, di cui è innamorato. Col passare del tempo, lo spirito innocente e ottimista di Richard riesce a far breccia in Griff, una figura carismatica nella scuola che ambisce a frequentare l'università e a dare un futuro migliore alla sua famiglia e successivamente negli altri ragazzi che iniziano a studiare e a comportarsi bene.