Se trata de una grabación recogida los días 24 y 25 de Noviembre de 1981 en el Forum de la ciudad canadiense ante un público de unas 18.000 personas cada noche. Son los únicos conciertos de Queen grabados en película (incluso la banda fue el primer grupo en grabar en 35mm).

En medio de la noche, Tomoe Enjō mata a sus padres a puñaladas en un ataque de ira, antes de escapar de su apartamento presa del pánico. No mucho después, un ladrón sin hogar encuentra sus cuerpos, pero cuando regresa con la policía, para su sorpresa, los encuentra siendo recibidos por los residentes en perfecto estado de salud. Algún tiempo después, Shiki ayuda a defenderse de algunos matones de la escuela que estaban atacando a Tomoe. Aparentemente tomado por la presencia de Shiki, rápidamente le pide que lo ayude a esconderlo, afirmando extasiado que es un asesino. Shiki está de acuerdo y simplemente cita que ella 'es igual que él' cuando se sorprende por su fácil aceptación de su estado.

Ambientada después de "Recuerdos borrados (Cuento de Hadas)", una nueva serie de feroces asesinatos ha llamado la atención tanto de Shiki como de Daisuke, el primo de Mikiya que investigó los asesinatos antes. Shiki deambula por los callejones del distrito comercial, buscando al asesino y evitando los ataques de los matones locales, mientras Mikiya se preocupa cada vez más por ella, comenzando su propia investigación que lo lleva por un camino poblado por traficantes de drogas y prostitutas. El perpetrador, Lio Shirazumi, encuentra a Shiki primero pero pierde un brazo en la pelea resultante; Al retirarse, descubre a Mikiya en su apartamento, que se ha convertido en un santuario de locos para Shiki. Mikiya intenta convencer a Lio de que puede salvarse, pero él se niega y se va. Shiki es capturada y torturada por Lio cuando ella se niega a matarlo, Mikiya llega al lugar pero no logra detener a Lio y termina herida. Shiki mata a Lio cuando le dice que él mató a Mikiya.

Cuando era niña, Miyori tuvo una experiencia en el bosque donde viven sus abuelos paternos, y es lograr ver los espítirus que protegen el bosque, donde la reina protectora la eligío como futura guardiana. Diez años después regresa a vivir con sus abuelos debido a la separación de sus padres. Angustiada por la ruptura, Miyori recorre el bosque que una vez la acogió, para encontrar que esos espíritus no se dejan ver por nadie mas que ella. Por medio del espíritu de una mujer que se ahorcó años atrás en el lugar, se da cuenta que su muy amado bosque, pronto desparecerá para dar paso a una represa, que inundará todo el bosque y las casas donde viven sus nuevos compañeros de la escuela y la de sus abuelos.

En 1995, Mikiya Kokutō se encuentra brevemente con una chica llamada Shiki Ryōgi mientras caminaba hacia su casa. Más tarde, en su escuela secundaria, Mikiya reconoce a Shiki entre la multitud. Él se presenta a ella. Si bien Shiki aparentemente ha olvidado su reunión anterior y se comporta de manera significativamente diferente, los dos se hacen amigos. Algún tiempo después, por la noche, Shiki sale de su casa para pasear por la ciudad de Mifune. Encuentra el cadáver de una víctima de accidente de tráfico y aplica su sangre en sus labios, aparentemente en trance.

La película comienza con una introducción de Kokuto Azaka sobre quién es ella y cómo planea ganarse a Mikiya como su amante a pesar de la presencia de una mujer peligrosa llamada Ryogi Shiki. Posteriormente, Shiki es enviada a la escuela de Azaka, la Academia Reien, durante las vacaciones de invierno para ayudar a investigar una serie de informes de hadas que roban los recuerdos del estudiante y un intento de suicidio sospechoso de Kaori. Los dos chocan de inmediato ya que Azaka está enamorada de su hermano (Mikiya) y considera a Shiki un rival amoroso. Mientras camina por la escuela, Shiki se da cuenta de un hada y la persigue. Azaka, que no puede ver a las hadas, se queda sola y es atacada por una persona desconocida y le roban la memoria, y se despierta por la noche sin recordar lo ocurrido. Descubren que el mago que usa las hadas está tratando de borrar los recuerdos de todos sobre el intento de suicidio de Kaori, pero la escuela tiene un registro escrito de la investigación.

Nota: los eventos de la película se presentan al espectador en formato no lineal. Esta sección describe los eventos en orden cronológico. En septiembre de 1998, la taciturna Shiki Ryōgi vive sola en un apartamento apenas amueblado donde suele visitarla un amigo cercano, Mikiya Kokutō. Un día, él la visita y le ofrece a Shiki helado Haagen-Dazs con sabor a fresa. Los dos se involucran en bromas amistosas. Más tarde, Shiki habla sobre una serie de suicidios que involucran a varias chicas de secundaria con el mago Tōko Aozaki, director de Garan no Dou (伽藍 の堂, Hollow Shrine), una agencia de detectives (de la cual Shiki y Mikiya son empleados) que se especializa en sucesos paranormales.

Fate/Prototype es una versión reimaginada de la versión original de Fate/stay night de Kinoko Nasu. La historia tiene lugar ocho años después del trágico Heaven's Feel. Aquí, el Santo Grial sigue siendo el objeto tan deseado. Sin embargo, la oscuridad bajo este llamado 'Grial' se revela mientras los personajes proceden a luchar entre sí para ganar.