Toisen maailmansodan tuhoista on vain noin vuosikymmen aikaa, kun yhteiskunta Japanissa elää jälleen uhkaavaa murroskautta. Taloudelliseen kasvuun voimakas satsaaminen ei pysty takaamaan hyvinvointia kaikille, ja levottomuudet alkavat ottaa sijaa. Ääriryhmät ja terrorismi lisäävät osaltaan kaaosta ja pelkoa. Järjestyksen ja rauhan ylläpitämiseksi, muodostaa hallitus entistä kovaotteisemmat ja laajemmin valtuuksin toimivat poliisivoimat. Nuori Kazuki Fuse kuuluu poliisin erikoisjaostoon. Erikoiskoulutetun, raskaasti panssaroidun ja aseistetun jaoston päätehtävinä on tuhota urbaani terrorismi - väkivaltaa kaihtamatta, uhrien määrästä välittämättä.Mutta eräs rutiinitehtävä menee Fusen kohdalta pieleen, jättäen häneen raskaat muistot.
PlayStation® -pelin suosittua tarinaa jatkavassa FINAL FANTASY VII -elokuvassa on kulunut kaksi vuotta Midgarin – saavutetun rauhan uhrausten muistomerkin – raunioitumisesta. Maailma kohtaa kuitenkin pian uuden uhan. Salaperäinen sairaus alkaa levitä nopeasti. Vanhat viholliset lähtevät liikkeelle. Sankariutta erakkoelämään paenneen Cloudin on astuttava taas esiin...
San Franciscossa äitinsä kanssa asuva Mia saa kuulla, että äiti on todellisuudessa eurooppalaisen Genovian prinsessa. Miaa houkutellaan ottamaan kuningaskunnan kruunu vastaan, muuten hallitsijasuku menettää valtakunnan. Kuningatar, Mian isoäiti, alkaa opettaa mahdollista tulevaa perijätärtä hovin tavoille. Kysymys tulevasta prinssipuolisosta on myös ajankohtainen.