Anna má 12 rokov, nemá veľa kamarátov a zo všetkého najradšej si sama kreslí. Pre zdravotné problémy „musí" na leto odísť zo Sappora k tete do ospalej prímorskej dedinky na ostrove Hokkaidó. Tu sa skamaráti s Marnie, ktorá žije vo vile v zálive. Priateľka Marnie Annu vťahuje do víru tajomstiev a dobrodružstiev, no Anna zisťuje, že tou najväčšou záhadou je Marnie sama.
Mewtwo, Pokémona vytvoreného pomocou bioinžinierstva z DNA Mew, jedného z najvzácnejších Pokémonov zo všetkých. Po jeho úteku z laboratória, kde bol vytvorený, je Mewtwo odhodlaný dokázať svoju vlastnú nadradenosť. Láka množstvo talentovaných trénerov do bitky Pokémonov ako nikdy predtým - a Ash a jeho priatelia túto výzvu samozrejme prijmú!