Rok 2019, blisko 30 lat po zakończeniu III Wojny Światowej. Odbudowane po ataku nuklearnym Neo-Tokio pogrąża się w coraz większej anarchii. Ulicami rządzą gangi, a grupy rebeliantów walczą z rządzącymi elitami. Dla Kanedy, młodego przywódcy gangu motocyklowego, taka sytuacja jest idealna. Do czasu, kiedy wojsko porywa jego najlepszego przyjaciela Tetsuo i wykorzystuje w tajnym eksperymencie o nazwie "Akira". Kaneda z przerażeniem odkrywa, że jego przyjaciel nie jest już tym samym człowiekiem co kiedyś, a co gorsza dysponuje potężną mocą mogącą zniszczyć całe miasto.

Chłopiec dorasta w dziczy bez żadnego kontaktu ze światem zewnętrznym. Pewnego dnia odnajduje go samotny myśliwy, który postanawia zabrać chłopca do domu i nauczyć go życia w cywilizacji. Młodzieniec stara się dostosować do nowego środowiska, wykorzystuje jednak te same mechanizmy i metody, które pozwoliły mu przetrwać w dziczy.

Po 13 latach od skazania Herberta Westa odwiedza go dr Philips. Wspólnie rozpoczynają eksperymenty na więźniach.