Η οργισμένη νύφη, τυφλωμένη από μίσος και διψασμένη για εκδίκηση συνεχίζει ακάθεκτη την εξόντωση των υπόλοιπων μελών της συμμορίας δολοφόνων "Φονικά Ερπετά". Αυτή τη φορά, εφαρμόζοντας στο έπακρο όλες τις πολεμικές της δεξιότητες ξεκινάει για τον ύστατο σκοπό της, την εξόντωση του αρχηγού της συμμορίας και πρώην "αφεντικού" της Μπιλ. Στο δρόμο της, θα αντιμετωπίσει τον αδελφό του Μπιλ, Μπαντ και την μονόφθαλμη Ελ. Στο τελευταίο σημείο του προορισμού της, η νύφη βρίσκεται πλέον αντιμέτωπη με τον Μπιλ σε μια σκληρή μονομαχία εικαστικής τελειότητας αλλά και ανάμεικτων συναισθημάτων που κόβει την ανάσα...
Ο Κλάρενς, ένας νεαρός μανιώδης των κόμικς και των ταινιών καράτε, γίνεται ένας από τους ήρωες που θαυμάζει, όταν με τη φίλη του Αλαμπάμα, μια αφελή πόρνη, φεύγει με μια βαλίτσα κοκαίνη για το Χόλιγουντ.
Ο Τόμσον και ο δικηγόρος του ξεκινούν ένα ταξίδι στην Αμερική με ένα κάμπριο αυτοκίνητο που αποκαλούν Κόκκινο Καρχαρία. Εφοδιασμένοι με μεγάλες ποσότητες ναρκωτικών, θα συναντήσουν αστυνομικούς, δημοσιογράφους, τζογαδόρους και ταξιδιώτες με ότο-στοπ στην ξεκαρδιστική τους αναζήτηση του Αμερικανικού Ονείρου!
O Νίο, ο Μορφέας, και η Τρίνιτυ μας «ξυπνάνε» μέσα στον αφόρητα πραγματικό και σκοτεινό κόσμο του Μάτριξ. Αποστολή του Νίο είναι, να σώσει σε 72 μόλις ώρες την Ζάιον, την τελευταία ελεύθερη πόλη, από ένα στρατό 250.000 φονικών μηχανών που απειλεί να την καταστρέψει. Σε αντίθετη περίπτωση το ανθρώπινο γένος θα εξαφανιστεί από προσώπου Γης. Οι κάτοικοί της ωστόσο, ενθαρρυμένοι από την πεποίθηση του Μορφέα ότι η προφητεία θα εκπληρωθεί και ο πόλεμος με τις μηχανές θα λάβει τέλος, χάρη στον «εκλεκτό» που είναι ο Νίο, εναποθέτουν όλες τις ελπίδες τους σ΄ αυτόν. Ο Νίο όμως, βασανίζεται από τρομακτικούς εφιάλτες που αφορούν τη ζωή της αγαπημένης του Τρίνιτυ.
Ο Νίο έχει παγιδευτεί στον «Σιδηροδρομικό Σταθμό», μια διάσταση κάπου ανάμεσα στο Μάτριξ και τον πραγματικό κόσμο. Ο Μορφέας, η Τρίνιτι και ο Σέραφ οργανώνουν την επιχείρηση διάσωσής του ζητώντας τη βοήθεια του Μεροβίγγιου. Εντωμεταξύ οι στρατιές των Μηχανών κατευθύνονται προς την Ζάιον, το τελευταίο οχυρό της ανθρώπινης αντίστασης ενάντια στην κυριαρχία τους. Όμως δεν έχουν ακόμη αντιληφθεί πως κάποιος έχει αποκτήσει τον έλεγχο του Μάτριξ με σκοπό να καταστρέψει τα πάντα: ο κύριος Σμιθ! Ενώ η Ζάιον αντιστέκεται σθεναρά στις καταιγιστικές επιθέσεις των Μηχανών, ο Νίο καταδύεται στα άδυτα του Μάτριξ σε μια ύστατη προσπάθεια να έρθει αντιμέτωπος με τον Σμιθ και να ματαιώσει τα σχέδιά του.