키류 센토가 창조한 새로운 세계에서 인체 실험을 받은 자들만 이전 시대의 기억을 되찾았다. 어느 날, 테러 조직과 협력해 세계정복을 노리는 사이먼 마커스와 매드 사이언티스트 우라가 케이지가 라이더들을 노린다. 압도적인 힘에 속수무책으로 당한 북도 삼우오는 빈사 상태에 빠지고, 이스루기 미소라는 납치되어 버린다! 미소라를 구출하고 적을 물리치기 위해선 그들이 가진 라이더의 변신을 해체하는 능력이 통하지 않는 가면라이더 그리스의 새로운 아이템을 창조해야만 한다. 하지만 완성에는 삼우오의 생명이 필요했다...!!

1954년, 고지라는 옥시전 디스트로이어로 산화되었다. 그러나 계속되는 핵실험으로 어느날 도시에 나타난 쇼키리스라는 바닷니가 나타나는데 쇼키리스가 갑자기 출몰하던 건 고지라가 나타났기 때문이다. 하지만 일본 정부는 고지라의 부활은 아직 인정할 수 없다며 진실을 은폐하는 행위를 하지만 얼마 뒤 고지라가 도로를 부수며 부활하며 결국 일본 정부는 고지라의 부활을 공식적으로 인정한다. 30년만에 돌아온 파괴신 고지라는 건물을 부수고 다리를 부수는 등 각종 악행을 저지른다, 결국 정부는 고지라에 대비해 제작한 신무기, 슈퍼 X를 출동시켜 고지라의 활동을 어느 정도 정지시키고, 방위군은 고지라를 화산으로 유도하여 화산을 폭발시키려는 작전을 세운다. 그러나 러시아는 고지라를 죽이기 위해 도쿄 본토에 핵폭탄을 떨어뜨리려 한다. 결국 러시아의 무모한 작전으로 고지라는 다시 회복되고 원자력 발전소를 부수어 에너지를 충전시킨다. 방위군은 다시 슈퍼 X를 출동시켜 고지라를 멈추려 하지만 고지라의 열선으로 정리된다. 이후 방위군은 고지라를 화산으로 유도시켜 화산을 폭발시켜 고지라를 화산에 묻어버린다.

가면라이더 오즈의 파이널 에피소드(제47화·최종화)를 타자키 류타 감독이 1개의 에피소드로 재편집하여 방송에서는 컷 된 미공개 장면 약 8분 추가! 에필로그 대사도 나오게 되어 보다 중후함으로 인해 농밀하게 마지막 회의 감동이 되살아나는 팬은 꼭 봐야한다! 음성특전에는 주연 와타베 히데루, 다자키 감독, 각본 고바야시 야스코, 다케베 프로듀서의 오디오 코멘터리도 수록!

태평양의 외딴 섬인 소겔 섬에 주둔하고 있는 과학자 팀은 기상관제 시스템을 완벽히 하려고 시도한다. 그들의 노력은 거대 사마귀와 늘 소란스러운 기자인 마키 고로가 섬에 도착하면서 방해받는다. 기상관제 시스템의 첫 번째 테스트는 순조롭게 진행되다 싶더니 섬의 중심에서 발생한 알 수 없는 신호로 인해 방사성 풍선의 리모컨이 걸려버리면서 실패하고 만다. 풍선이 폭발하면서 방사능 폭풍을 일으켜 거대 사마귀는 카마키라스로 변한다. 과학자들은 카마키라스들이 흙더미에서 알을 파내는 것을 발견한다. 알이 부화하면서 미니라가 태어나고, 과학자들은 미니라의 울음소리가 그들의 실험을 망친 방해의 원인이었다는 것을 깨닫는다. 곧 고지라가 미니라를 지키기 위해 돌진하면서 우연히 과학자들의 근거지를 밟으며 섬에 상륙한다. 고지라는 상륙하자마자 카마키라스 두 마리를 박살낸다. 한 마리는 반복되는 슬램을 뚫고 산산조각이 나고 다른 한 마리는 고지라의 방사열선에 폭사당한다. 세 번째 카마키라스는 고지라에 의해 몸이 꺾이면서 죽고, 마지막 한 마리는 결국 달아난다.