تدور أحداث الفيلم حول شاب مغامر يدعى (ميلو) ينضم لفريق من المستكشفين الجريئين يحاولون العثور على قارة أطلانتس المفقودة.
تصعد مجموعة من الخاطفين المدججين بالسلاح على متن سفينة فاخرة للمحيط في جنوب المحيط الهادئ لنهبها ، فقط لخوض معركة مع سلسلة من الكائنات البحرية كبيرة الحجم وذات المجسات وتأكل الإنسان والتي استولت على السفينة أولاً.
يتم استدعاء الدكتور (نورمان جودمان) ضمن مجموعة من العلماء إلى وسط المحيط الهادئ، لتقصي حقيقة حطام ما يعتقد بأنه سفينة فضائية ترقد على مسافة ألف قدم تحت سطح الماء.
تم تكليف لارا كروفت من قبل MI6 للعثور على صندوق باندورا الأسطوري ، وهو كائن من الأساطير القديمة التي من المفترض أن تحتوي على واحدة من أكثر الأوبئة فتكا على الأرض ، قبل أن يتمكن العالم الشرير الحائز على جائزة نوبل الذي تحول إلى إرهابي بيولوجي جوناثان ريس من وضع يديه عليه. تغامر لارا بالذهاب إلى معبد تحت الماء بحثا عن جرم سماوي سحري مضيء ، مفتاح العثور على صندوق باندورا ، ولكن بعد تأمينه ، يتم سرقته على الفور من قبل الزعيم الشرير لعصابة الجريمة الصينية الذي يخطط بدوره لبيع الجرم السماوي إلى ريس. يجب على لارا استعادة الصندوق قبل أن يستخدمه العقل المدبر الشرير ريس لبناء سلاح ذي قدرات كارثية.