47 ans se sont écoulés depuis l'apparition de Godzilla et aujourd'hui, le grand monstre est de plus en plus considéré comme une simple légende. Mais d'étranges disparitions de navires commencent à se produire et bientôt, leur origine ne fait plus de doute : Godzilla est de retour pour réduire le Japon en miettes. Au même moment, Yuri, une jeune journaliste, rencontre un vieux prophète qui lui annonce que le combat ultime pour la survie du pays est sur le point de commencer. Car cette fois, le Japon n'est pas sans défense face au roi des monstres : Baragon, Mothra et King Ghidorah, ses monstres protecteurs, vont sortir de leur sommeil pour tenter de le vaincre. Et personne ne sortira indemne de la « battle royale » qui s'annonce...

1964. Une guerre atomique a ravagé presque toute l'hémisphère nord de la planète. Un sous-marin américain fait alors escale en Australie. Mais les retombées radioactives se rapprochent lentement...

Un test nucléaire, Operation Experiment, est conduit au-delà du Cercle Arctique. Mais l'explosion réveille une créature gigantesque, endormie sous la glace depuis 100 millions d'années, qui commence à se diriger vers la côte Est des États-Unis.

Un sous-marin atomique américain, le Neptune, coule après avoir percuté un cargo. Le capitaine Blanchard et son équipage sont toujours vivants mais n'ont que 48 heures d'oxygène. Une durée qui ne laisse pas beaucoup de temps au ministère de la Marine pour sauver l'équipage de Neptune…

Les habitants de la cité engloutie de Mu, disparue voilà 12000 ans, ont décidé d'investir la surface de la Terre. Ils font enlever la fille du Professeur Shinguji qui avait construit à la fin de la deuxième guerre mondiale, un sous-marin capable d'atteindre les fantastiques profondeurs de leur monde. Un terrible combat pour sauver la race humaine commence à la surface du globe quand les habitants de Mu lancent une fulgurante attaque et sous les eaux, où un gigantesque serpent de mer protège l'entrée de leur royaume...

Le 6 août 1945, un B-29 américain lâche la première bombe atomique sur la ville d’Hiroshima… Face à cette nouvelle menace, les autorités militaires japonaises confient une mission de la plus haute importance au Capitaine Masami Asakura qui se voit confier le commandement d’un sous-marin ramené d’Allemagne par une équipe de scientifiques : le I-507. Sa mission : trouver le vaisseau américain qui achemine la seconde bombe atomique et l’empêcher de mener sa tâche à bien. Mais comment faire alors que les eaux grouillent de navires américains? Masami ne tarde pas à découvrir la présence à bord de son sous-marin d’une arme secrète d’origine nazie appelée Loreleï, un petit submersible avec à son bord une jeune japonaise… Pourra-t-elle empêcher le lancement de la deuxième, mais surtout de la troisième bombe atomique visant à rayer Tokyo de la carte ?

Eté 2010. Australie. Cinq amis partent en croisière pour des vacances de rêve. Mais lorsqu'ils font naufrage, le rêve vire au cauchemar : dans l'eau rôde une terrible menace...

Des anciens marins devenus zombies gardent le trésor dans les cales de leur ancien navire, une épave coulée quelques soixante années plus tôt. Un groupe de pilleurs d'épave, faisant fi de la légende décident d'explorer les lieux, persuadés y trouver des diamants. Il vont se rendre compte à leur dépends que de la légende à la réalité, il n'y a souvent qu'un coup de palmes.

Un scénariste fait des recherches pour son nouveau scénario en kidnappant réellement et jeunes filles noyade. Il les place ensuite dans son « jardin » d'autres filles mortes qui reviennent tous les jours pour vérifier sur eux. Une fille échappe de justesse et les autres corps sont retrouvés conduit à un complot ingénieux pour essayer de capturer le tueur.

Un sous-marin nucléaire américain pointe ses missiles sur Washington et menace de tout faire sauter, le Capitole, la statue de Lincoln et la population, si le gouvernement ne verse pas une colossale somme d'argent. Krieg, le capitaine du bâtiment, pris de folie, modifie ensuite sa sommation et exige la démission du Président. La Maison-Blanche est embarrassée. La cellule de crise ignore encore que, dans le secret des soutes, Doc et Piersall, deux membres de l'équipage, désapprouvent les nouvelles orientations prises par leur supérieur et vont tout tenter pour faire échouer son chantage...

À la suite d'un tremblement de terre, une station sous-marine, le Sealab, se retrouve perdu dans les fonds marins. Un sous-marin ultra-perfectionné est envoyé à sa rescousse, mais rencontrera de multiples dangers

En 1903, embarqués sur un petit bateau, un marin et deux jeunes gens sont happés par le courant de la marée. Ils sont entraînés dans une espèce de tunnel formé par les eaux et débouchent dans une cité mille lieux sous les mers. Cet empire perdu peuplé d'habitants parfaitement capables de respirer sous l'eau est dirigé par un capitaine immortel. La cité est alimentée en électricité par un volcan sous-marin. Mais la ville est en proie à de terribles malédictions et les trois aventuriers doivent absolument trouver le moyen de remonter à la surface pour échapper au contrôle du capitaine ....

Colossus est la plus gigantesque plate-forme de forage jamais construite. Située dans les eaux glacées de l'Atlantique nord, près des côtes du Groenland, cette mégaconstruction perce le fond marin des profondeurs pour en soutirer le pétrole. Colossus inquiète grandement les géologues quant à son impact environnemental catastrophique possible. Lors du forage, une fissure sous-marine s'entrouvre et révèle un océan miroir, reclus et autosuffisant depuis des millions d'années. Un océan parrallèle de vie marine et de créatures préhistoriques. À l'intérieur, le plus grand prédateur aquatique à avoir jamais existé : le « carcharodon megalodon ».