Η Σίγκνε και ο Τόμας διατηρούν μια αρρωστημένη, ανταγωνιστική σχέση, η οποία παίρνει μια άσχημη τροπή όταν ο Τόμας αποκτά ξαφνικά αναγνώριση για το καλλιτεχνικό του έργο. Γνήσια αντιδραστική, η Σίγκνε επιχειρεί απεγνωσμένα να ανακτήσει το στάτους της δημιουργώντας μια νέα, αδίστακτη περσόνα, η οποία τρέφεται από την προσοχή και τη συμπόνια των άλλων.
Μια βραδιά στη Νέα Ορλεάνη, κακοποιοί σκοτώνουν έναν μετανάστη. Την επόμενη ημέρα, ο Δρ Ριντ του υγειονομικού επιβεβαιώνει πως το θύμα έπασχε από πνευμονική πανώλη. Τώρα, πρέπει να βρουν τους δολοφόνους ώστε να περιορίσουν την μετάδοση και να αποτρέψουν τον πανικό που μπορεί να προκληθεί με την εξάπλωση της είδησης...
Στο νέο κεφάλαιο της επικής ιστορίας του «Λαβυρίνθου», ο Τόμας και οι σύντροφοί του αντιμετωπίζουν την μεγαλύτερη τους πρόκληση μέχρι τώρα: να ψάξουν για στοιχεία σχετικά με την μυστηριώδη και παντοδύναμη οργάνωση γνωστή ως Τμήμα Παγκόσμιας Καταστροφής (WCKD). Το ταξίδι τους τούς φέρνει στη Πύρινη Γη, ένα ερημικό τοπίο γεμάτο με αφάνταστα εμπόδια. Ενώνοντας τις δυνάμεις τους με αντιστασιακούς πολεμιστές, τα μέλη της ομάδας τα βάζουν με τις κατά πολύ ανώτερες δυνάμεις του WCKD και αποκαλύπτουν τα σοκαριστικά της σχέδια για αυτούς.
Οκτώ ταλαντούχοι υποψήφιοι έχουν φτάσει στο τελικό στάδιο επιλογής, για τη στελέχωση μιας μυστηριώδους και ισχυρής εταιρείας. Εισέρχονται λοιπόν σε ένα δωμάτιο χωρίς παράθυρα, όπου ένας επιτηρητής, τους δίνει 80 λεπτά για να απαντήσουν σε σε μία και μόνη ερώτηση.
Τρεις τρομοκράτες επιχειρούν να ανατινάξουν τον Διεθνή Οργανισμό Υγείας στη Γενεύη. Ο ένας ξεφεύγει, έχοντας όμως εκτεθεί σε θανατηφόρο ιό, κι επιβιβάζεται στο τρένο για Στοκχόλμη. Οι Αρχές επιθυμούν να κατευθύνουν το τρένο σε μια εγκαταλειμμένη σιδηροδρομική γραμμή των Ναζί, για να τεθεί σε καραντίνα. Θα πρέπει όμως να περάσει από μια παροπλισμένη γέφυρα που είναι αμφίβολο αν θα αντέξει το βάρος.
Σε ένα κόσμο που μαστίζεται επί χρόνια από έναν ιό που μετατρέπει τους ανθρώπους σε ζόμπι με τάσεις κανιβαλισμού, η θεραπεία είναι πλέον γεγονός και η δύσκολη διαδικασία της επανένταξης των επιζώντων στην κοινωνία ξεκινά. Ανάμεσα στους πρώην αρρώστους είναι και ο Senan, ένας νεαρός άνδρας που στοιχειώνεται από τις τρομακτικές ενέργειες που διέπραξε όταν είχε προσβληθεί. Ο Senan καλωσορίζεται πίσω στην οικογένεια της χήρας κουνιάδας του και προσπαθεί να ξαναρχίσει τη ζωή του, είναι όμως η κοινωνία έτοιμη να συγχωρήσει αυτόν και άλλους σαν και αυτόν; Η ο φόβος και η προκατάληψη θα διαλύσουν και πάλι τον κόσμο;..
Μια παρέα φοιτητών νοικιάζουν μια απόμερη καλύβα μέσα στο δάσος, με σκοπό να διασκεδάσουν. Αλλά ο ένας μετά τον άλλον αρχίζουν να πέφτουν θύμα ενός σαρκοφάγου ιού.