यह कहानी प्यार और रोमांच की क्लासिक कहानी है इसमें खूबसूरत बटरकप का अपहरण करके राजकुमार हम्पर्डिंक से शादी करने के लिए उसे उसकी इच्छा के विरुद्ध रखा जाता है, और वेस्टली (उसका बचपन का प्रेमी, जो अब भयंकर पाइरेट रॉबर्ट्स के रूप में लौटा है) उसे बचाने का प्रयास करता है।
जोकर को पराजित करने के बाद, बैटमैन अब पेंग्विन का सामना करता है - एक ताना-बाना और विकृत व्यक्ति, जो गोथम समाज में स्वीकार किए जाने पर आमादा है, एक बदमाश व्यवसायी, मैक्स स्क्रेक की मदद से, जिसे वह मेयर की स्थिति के लिए चलाने में उसकी मदद करने में साथ देता है। गोथम, जबकि वे दोनों बैटमैन को एक अलग रोशनी में फ्रेम करने का प्रयास करते हैं। बैटमैन को अपना नाम साफ करने का प्रयास करना चाहिए, सभी को यह भी तय करना होगा कि रहस्यमय कैटवूमन के साथ क्या किया जाना चाहिए।
एक परमाणु परीक्षण के असर से बहुत ही विशाल जीव पैदा हो जाता है, जो मैनहैटन पहुंच जाता है और अपने रास्ते में आने वाली हर चीज़ को तबाह करना शुरू कर देता है.