Amnezija je spasila posada talijanskog ribarskog broda kad pluta na moru. Nema identitet i prošlost, ali posjeduje niz izvanrednih talenata u lingvističkim, borilačkim i samoobrambenim umijećima koji sugeriraju profesiju rizika. Zbunjen i dezorijentiran, on poduzima besnu potragu da otkrije tko je i zašto je njegov život preuzeo tako opasan zaokret.
Nakon što je izgubio pamćenje i jedinu osobu koju je volio, Bourne je prisiljen razotkriti svoju prošlost kako bi mogao imati budućnost. Putujući od Moskve, Pariza, Londona do Tangera i New Yorka, nastavlja potragu za pravim Jasonom Bourneom – cijelo vrijeme nastojeći nadmudriti brojne policajce, savezne časnike i Interpolove agente koji ga drže na nišanu.
Prošlost Jason Bournea vraća se po njega. U drugom dijelu sage o tri filma koja se temelji na životu Jason Bournea, bivšeg CIA-inog agenta koji gubi pamćenje i dok se bori da ga oporavi i otkrije tko je on, našao se uključen u mrežu špijunaže i vladine manipulacije od strane Sjedinjenih Država gdje će ga progoniti profesionalni ubojice, paravojni plaćenici i bivši CIA-ini drugovi. Film započinje u Goi u Indiji, gdje su Jason i Marie otišli živjeti da bi se sakrili od Treadstonea, ali tamo ima bivšu tvrtku agent ih locira i progoni. Jason Bourne započinje svoju avanturu da otkrije svoju prošlost sjećanjem se dijela toga i progoni agenta koji se također predstavlja kao on.
Dva bostonska detektiva istražuju otmicu male djevojčice a istraga vremenom postaje i profesijonalni i privatni problem.
X (Daniel Craig) zaradio je bogatstvo prodajući kokain i ostale opojne droge. Sad se želi povući iz posla dok je još mlad kako bi uživao u svojem "prljavom" novcu. Međutim, kriminalni šef Jimmy Price (Kenneth Cranham) treba nekoliko njegovih usluga prije nego što će mu dopustiti umirovljenje. Mora pronaći razmaženu ovisnicu, kćer Jimmyjevog starog prijatelja i konkurenta Eddija Templea (Michael Gambon) koja je nestala. Zatim Price želi da posrednik kupi golemu pošiljku ecstasyja od nepredvidljivoga prevaranta Duke (Jamie Foreman). U priču se uključuje i gangster čija djevojka baca oko na X-a.