Para staruszków przyjeżdża do Tokio, by odwiedzić dzieci i wnuki. Niestety, młodzi są ciągle zabiegani. Starsi państwo nie mogą się oprzeć wrażeniu, że ich wizyta zamiast radości wywołuje konsternację. Decydują się na powrót do domu. Gdy wkrótce seniorka rodu umiera, dzieci i wnuki składają rewizytę.
Niedaleka przyszłość. Populacja mutantów skurczyła do kilku osobników. Zmęczony życiem Logan (Hugh Jackman) opiekuje się schorowanym Profesorem X (Patrick Stewart) w kryjówce przy granicy meksykańskiej. Pewnego dnia nieznajoma prosi by zaopiekował się Laurą (Dafne Keen) - młodą mutantką ściganą przez tajemniczą organizację. Czy Logan da radę ochronić dziewczynę, z którą ma więcej wspólnego niż mu się wydaje?
Choć postrzelonego Jasona Bourne'a uratowano od śmierci, całkowicie stracił pamięć. Wkrótce okazuje się, że jeżeli chce przeżyć, musi poznać swoją prawdziwą tożsamość. Ścigany przez swych prześladowców i upływający czas, Bourne odkrywa, że i on ma instynkt zabójcy...
Kontynuacja losów Jasona Bourne'a - byłego tajnego agenta CIA. Okazuje się, że program Treadstone został zmodyfikowany i przemianowany na Black Briar, podlegający amerykańskiemu Ministerstwu Obrony. Agencja odcięła się od swojej niechlubnej przeszłości, jednak wciąż obawia się zagrożenia ze strony Bourne'a, postanawia więc go zlikwidować. Tymczasem Bourne'a prześladują niejasne wspomnienia z jego przeszłości sprzed zaniku pamięci. Ucieczka przed poprzednim życiem okazuje się być niemożliwa, dlatego Bourne postanawia wrócić do początku i dowiedzieć, kto i po co go stworzył. Podróżując przez Moskwę, Berlin, Londyn, Madryt, dotrze w końcu tam, gdzie wszystko się zaczęło i musi się skończyć - do Nowego Jorku.
W roku 2002 widzowie w kinach na całym świecie poznali Jasona Bourne'a - bohatera sfilmowanego bestsellera Roberta Ludluma "Tożsamość Bourne'a". Teraz Jason Bourne powraca w drugiej części - "Krucjata Bourne'a". Dwa lata temu Bourne'owi wydawało się, że zdołał uciec przed przeszłością. Wraz z Marią przenosili się z miasta do miasta, ścigani urywkami wspomnień, których nie rozumieli. Uciekali przed nocnymi koszmarami, których znaczenia nie znali. Przypadkowe spojrzenie nieznajomego, pomyłkowy telefon - w każdej sekundzie, bez ostrzeżenia przeszłość mogła wrócić. I ta przeszłość powróciła. Ale... Bourne został wyszkolony na zawodowego zabójcę. Ci, którzy go ścigali, powinni byli zostawić go w spokoju. Przekonają się o tym.