Hrdinou příběhu je stárnoucí samuraj Isaburo. Žije poklidným životem, dokud mu jeho pán nepřikáže aby oženil svého syna Yogora s konkubínou, jež upadla v nemilost i přesto, že vládci porodila syna. Ačkoliv se Isaburo zprvu zdráhá, Yogoro přijme Ichi za ženu a zakrátko se mezi nimi probudí silný cit. Jijich láska starému samuraji vrátí síly a tak když zemře vládcův starší syn a on pošle pro Ichi, aby mu stanula po boku jako matka jeho dědice, Isaburo se pánovi postaví na odpor.

Bouřlivá léta pádu šógunátu charakterizují nekonečné likvidace nepohodlných osob a konflikty procísařských a šógunátních skupin. Na pozadí těchto událostí prochází jako přízrak smrti muž jménem Rjúnosuke Cuke, jenž ovládá meč s bravurou mistra, ale jehož duše je zlá a krutá. Zůstávají za ním mrtvoly politicky aktivních osob i obyčejných lidí. Ovšem vše souvisí se vším a jeden čin neodvratně ovlivňuje činy druhých. Jedho smrt si přeje stále více lidí, ale je vůbec možné zastavit zosobněné zlo?

Zatoichi se vydává do své staré vesnice s přáním najít klid, ale narazí jen na problémy, když se zaplete do milostného trojúhelníku a zjistí, že ho domů pronásledují staré účty.

Japonsko na konci 16. století je zmítáno nepokoji a boji o moc v nejvyšších kruzích. Lid přestal mít důvěru k šlechticům a jejich slibům o ukončení věčných válek. Lidé jsou nadšeni jednáním ninji Goemona. Ten okrádá bohaté a dává chudým. Goemon má velmi bolestivou minulost, která se začíná čím dál více projevovat v jeho současném životě. Aniž by chtěl, zaplete se Goemon do boje o moc mezi šlechtici. 

Po příjezdu do města Šimonita Iči zjistí, že na jeho hlavu vypsal odměnu místní šéf jakuzy. Je vtažen do pasti, ale poté, co se dozví o zabití své bývalé lásky, se Iči zuřivě probojuje celým klanem, aby se postavil vrahovi, najatému róninovi.

Zatoichi narazí na umírajícího muže, který ho požádá, aby dal "Taichimu" pytel peněz. Zatoichi netuší, o koho se jedná, ale když dorazí do malého městečka obtěžovaného gangstery, zjistí, že "Taichi" byl mužův malý syn. Na svých cestách se také setkává se slepým mnichem, který Zatoichiho nutí pochybovat o svém vražedném životním stylu. Ve snaze pomoci městečku Zatoichi zabije několik gangsterů a stane se pro chlapce hrdinou. Musí se rozhodnout, zda použije nenásilí a půjde dobrým příkladem, nebo násilí a navede chlapce na špatnou životní cestu.