Andre del av trilogien begynner når Doc, Marty og Jennifer tar tidsmaskinen til år 2015 for å ordne opp i McFly-familiens fremtid. Men Biff Tannen stjeler maskinen og gir sitt yngre jeg en bok som inneholder 50 år av sportsstatistikker - noe den unge Biff bruker til sin, men ingen andres, fordel. For å forandre på historien må Marty og Doc reise tilbake til 1955 og hente boka.

Scott Pilgrim forelsker seg i den søte jenta Ramona, men hvis han skal vinne hjertet hennes, må han først kjempe mot – og beseire – de syv onde ekskjærestene hennes.

Max er i ferd med å starte sitt nye drømmeliv på college hvor både kunnskap og sport står på timeplanen. Men også total frihet – nå får han endelig stå på egne ben uten å måtte ha sin kønete pappa ved sin side! Men når Langbein får sparken og tvinges til å ta en ordentlig utdannelse, havner han på samme skole som sønnen. Max sine drømmer forvandles snart til et mareritt når Langbein tar den helt ut med sin pinlige 70-tallsstil, slengbukser og diskodans. Det blir ikke bedre når han ufrivillig blir dratt inn i idrettens verden, hvor han blant annet forsøker å blir mester på skateboard…

Skilpaddene hadde en erkefiende i mange år, Shredder, som de til slutt klarte å beseire. I tiden etterpå har skilpaddene vokst litt fra hverandre som familie, og deres læremester, rotten Splinter, strever med å holde dem samlet. Splinter blir bekymret når merkelige ting begynner å skje i New York, og trenger å få skilpaddene til å stå samlet for å kunne hamle opp med det som venter.