Основан на събития по действителен случай, филмът разказва за най-голямото бягство от затворнически лагер през Втората световна война. Първата част на филма е съсредоточена върху подготовката за измъкването на близо стоте съюзнически затворника от този невероятно строг лагер, а втората - за премеждията, които ги очакват навън сред вражеска земя.

Единственото, което Джейсън Борн искаше, беше да забравят за него и да го оставят да изчезне. Но бившите му шефове го подгониха и бившият смъртоносен агент е принуден да се пребори с амнезията си. Борн продължава да търси истинската си самоличност, но този път има и партньор в лицето на журналиста Сам Рос. Още на първата им среща Борн разбира, че враговете му ще правят всичко възможно да убият репортера. За да помогне на Рос и да разкрие миналото си, Борн трябва отново да обиколи планетата - мисията му ще го отведе до Москва, Ню Йорк, Лондон, Париж и Мадрид.

Джейсън Борн си мисли, че е успял да избяга от миналото си. Но ето, че миналото му е на път да отново да го настигне. Борн и Мари, с цената на много усилия се опитват да водят обикновен живот. Преследван от кошмари от минало, което не може да си спомни, Борн и приятелката му непрекъснато се местят от град на град. Но възможно ли е да избегне невидимата заплаха, която го дебне в погледа на всеки непознат, във всяко грешно обаждане; заплаха, която всеки момент, без предупреждение, ще го върне отново в света, който си мисли, че е оставил зад себе си.