Egy gyógyíthatatlan beteg kislány édesanyja Rose (Radha Mitchell) képtelen beletörődni az orvosok diagnózisába. A gyógyulás útját keresve megszökteti lányát, férje (Sean Bean) minden tiltakozása ellenére. A szökés során balesetet szenvednek és Silent Hill elhagyatott, hátborzongató városába jutva szem elől veszítik egymást, ami nem csoda, hiszen a városra állandó köd telepedik. Silent Hill nem csak ebben különbözik a többi várostól: furcsa lények lakják és időről időre az élő Sötétség telepedik rá, megfertőzve mindazokat, akiket megérint. Rose gyermeke keresése közben egyre többet tud meg a város történetéről és rá kell döbbennie, hogy lánya eltűnése csupán apró porszem egy sokkal komolyabb játékban.
Roy kisfia, Alton olyan titokzatos képességekkel bír, melyek miatt vallási szekták célpontjává válik. Apja és fia menekülni kényszerülnek, és az éjszakai szökésből hamarosan országos hajsza lesz, amelybe a legmagasabb kormányzati körök is bekapcsolódnak. Roy mindent kockára tesz, csak hogy fia teljesíthesse feladatát... bármi is legyen az.
Egy fiatal pár békés utazgatásra indul, eljutva a nyugodtnak és kihaltnak tűnő Gatlin városkába. Megérkezésük előtt kisebb baleset éri őket, azonban a városban még több borzalom vár rájuk. Megpróbálják felvenni a küzdelmet a Gatlin felnőtt lakosságát kiírtó gyermeki hitközösséggel és annak vezetőjével.
Tom és Gwen kempingezni mennek az Észak-Kaliforniai Jasper parkba, ám a lány számára a kiruccanás rémálommá válik, amikor a vadőr a szeme láttára öli meg Tomot, őt pedig elkapják és bezárják egy földalatti építménybe. Rövid idővel később egy nagy társaság érkezik a parkba, akik egy vállalatnál dolgoznak és paintballozni jöttek. Az első éjszaka folyamán azonban az egyiküknek olyan érzése támad, mintha figyelnék őket. Amikor másnap elkezdődik a játék, rájönnek, hogy immár az életben maradás a tét.