Este romance é contado do ponto de vista de um protagonista sem nome, que encontra por mero acaso, um diário num hospital. O diário pertence à sua colega de turma, uma rapariga chamada Sakura Yamauchi, e acaba por descobrir que ela sofre de uma doença terminal no pâncreas e que tem apenas alguns meses de vida. Sakura explica que o protagonista é a única pessoa, além da sua família, que sabe sobre a sua condição. Este promete guardar o seu segredo. Apesar das suas personalidades completamente opostas, acaba-se por se envolver com a Sakura, nos seus últimos meses de vida.
História original, que ocorre após os eventos do primeiro filme.
Uma nova organização terrorista conhecida como "11 Individuais" está empenhada na destruição em massa. Será que a Major Kusanagi e a sua unidade anticrime de elite serão capazes de detê-los?
A existência de "sub-humanos" que instantaneamente regeneram os seus corpos, não importa como morram, é um sonho da humanidade e tem um valor de utilidade infinito. Até agora, 46 sub-humanos foram confirmados no mundo sendo 2 no Japão, mas um dia, Kei Nagai, um estudante do secundário, regenerou-se imediatamente após morrer em um acidente de trânsito, e assim foi descoberto que ele era o terceiro sub-humano no Japão... Kei será perseguido pela polícia, pelo Comitê Administrativo dos "sub-humanos" e por todas as pessoas que procuram o ganhar o prêmio em dinheiro colocado sobre a cabeça dos "sub-humanos".
Algum tempo depois após o 63º torneio sensha-do, o Ministério da educação Japonês decide dar continuidade com seu plano fechar a Academia Feminina de Ooarai, apesar do recente triunfo no campeonato. A fim de manter a escola aberta, Miho e sua equipe deve vencer uma partida contra uma equipe da Universidade sensha-dou.
Num mundo utópico e futurista, onde a humanidade adquiriu a vida eterna, uma jovem agente de alto escalão da principal empresa de saúde do mundo investiga uma onda de suicídios.
Passaram seis anos desde que Taichi "Tai" Kamiya e os seus amigos atravessaram pela primeira vez para o Mundo Digital e se associaram ao seu Digimon, mas agora há uma nova ameaça de Digimon infetado que está a criar o caos na cidade.
Uma jovem determinada que cresceu num orfanato descobre que tem poderes mágicos após ser adotada por uma bruxa egoísta.