Zombie zaútočili na letisko v Harvardville a uvrhli ho do chaosu. Leon S. Kennedy a Claire Redfieldová, ktorí pred siedmymi rokmi behom tragédie v Raccoon City bojovali proti zločinnej organizácií Umbrella, sú späť. Podobne ako v predošlých filmoch série Resident Evil, aj teraz sú pripravení stretnúť sa so zlom. Ich protivníkom je tentokrát darebný bojovník, ktorý potom, ako prišiel o celú rodinu v Raccoon City, túži po odplate. Smrteľný G-Virus sa začína šíriť a nové zmutované monštrá sa púšťajú do šialeného vyčíňania. Dokáže Claire s Leonom zastaviť vírus skôr, než sa bude história znova opakovať?
Posledných dvesto rokov je útočiskom ľudskej rasy podzemné gigantické mesto Ember. Teraz však stojí na pokraji zániku. Generátor, poskytujúci jeho obyvateľom energiu, ktorá zaisťuje svetlo, teplo a vzduch dosluhuje a začína zlyhávať. Obrovské sklady potravín sú už temer prázdne a komplikujú sa aj dodávky vody. Klesá morálka tých, čo prežili. A nikto nevie, čo nastane, až sa celé mesto ocitne v temnote. Lina (Saoirse Ronan) a jej kamarát Doon (Harry Treadaway) práve dokončili školu a dospeli ku Dňu rozradenia. Lina bola pridelená medzi poslíčkov a Doon sa stal opravárom potrubia. Obaja si začínajú uvedomovať, že mesto Ember sa blíži k svojmu zániku. Jediný spôsob, ako prežiť, je utiecť odtiaľ.
Ľudia v nie tak vzdialenej budúcnosti už rezignovali na priame medziľudské kontakty a všetku komunikáciu a interakciu zažívajú prostredníctvom klonov, ktoré majú nahradiť človeka v reálnom živote. Agent FBI Greer vyšetruje vraždu študenta, ktorý bol v spojení s tvorcom high-tech systému klonov Canterom. Netuší, že ide o začiatok série útokov na humanoidných robotov, ktoré zároveň končia smrťou ich skutočných ľudských majiteľov. Obeťou sa stáva aj robotický náhradník agenta Greera, ktorý sám vyviazne len o vlas. Musí tak po rokoch opustiť bezpečie svojho bytu a vydať sa do ulíc pátrať osobne. Prípad rieši spolu s agentkou Petersovou. Do ich pozornosti sa dostávajú dve protipólne postavy – bývalý šéf VSI Canter a vodca skupiny odboja proti modernému štýlu života prostredníctvom robotov prezývaný Prorok.
Trinásťročný Akadčan Mathayus sa mohol len bezmocne prizerať, keď zradný čarodejník Sargon uniesol a zavraždil jeho milovaného otca, pretože mu závidel a považoval ho za svojho najväčšieho protivníka. Prešlo sedem rokov, počas ktorých z neho tajný Rád Čierneho škorpióna tvrdým drilom spravil dokonalého bojovníka (Michael Copon), schopného pomstiť otcovu smrť. No aby dokázal poraziť Sargona, ktorého moc sa vďaka čiernej mágii v uplynulých rokoch znásobila, musí z podsvetia priniesť legendárny prekliaty Damoklov meč! Preto sa s odvážnou a krásnou Laylou, gréckym spisovateľom Arim a oslobodeným zajatcom Fongom vydáva do Egypta na dych vyrážajúcu odyseu, aby sa nielen pomstil, ale tiež zachránil Akádsku ríšu – a svoju vlastnú dušu.