تدور احداث الفيلم عندما تخرج من أعماق المحيط وحوش عملاقة آتية من عالم آخر، تقوم بتدمير مدن بأكملها وتودي بحياة الملايين، يقوم البشر بصناعة آليين هائلي الحجم يطلق عليهم "جياجرز" لمحاربة تلك الكائنات، على أن يتم التحكم في كل جياجر عن طريق طيارين من البشر، لكن كل هذا لا يجدي نفعاً أمام تلك المخلوقات الجبارة، وتستمر الحرب لأكثر من 20 عامًا، تكاد فيها حضارة البشر أن تنهار، قبل أن يبزغ أمل جديد في الأفق.
بعد هزيمة الدكتور هيل، تقاعد البطل كوجي وأصبح عالِمًا لجعل الأرض أكثر أماناً. لكن (هيل) يهاجم الأرض ثانية، فيحاول كوجي إيقافه بأية طريقة