Rastoči populaciji gensko naprednih opic, ki jih vodi Cezar, grozi tolpa ljudi, ki so pred desetimi leti preživeli epidemijo smrtonosnega virusa. Dosežejo nestabilno premirje, ki pa ne traja dolgo, saj se nasprotni strani znajdeta na robu vojne, ki bo odločila, katera vrsta bo prevladala planetu Zemlja.
V ospredju prednadaljevanja Planeta opic je Caesar, superinteligentni šimpanz, ki ga je s poskusom ustvaril ambiciozni znanstvenik; žival povede opičjo raso v upor proti človeštvu, ki utegne spremeniti usodo planeta. Nadarjeni mladi znanstvenik Will Rodman skuša s pomočjo kolegice Caroline Aranha odkriti novo zdravilo, zato prične z genetskimi poskusi na opicah. Najbolj uspešni opičji testni primerek Caesar začne kmalu kazati znake višje inteligence, a vedno znova naleti na neodobravanje ljudi, ki se ga bojijo in ga želijo za vedno ohraniti za rešetkami. Toda s pomočjo novih spoznanj Caesar uide in sproži upor inteligentnih opic proti človeštvu. Vojna med ljudmi in opicami grozi, da bo za vselej spremenila usodo sveta.
Zgodba se dogaja nekaj generacij po Cezarjevi vladavini. V tem svetu so opice prevladujoča živeča vrsta na Zemlji in živijo v harmoniji, človeška rasa pa je močno okrnjena in živi v senci opic. Medtem ko novi tiranski vodja opic gradi svoj imperij, se ena izmed mlajših opic poda na mučno potovanje, zaradi katerega podvomi v vse, kar je vedel o preteklosti ter mora sprejeti odločitve, ki bodo določile prihodnost tako opic kot ljudi.
Primatolog Davis Okoye (Dwayne Johnson), ki sicer ne dovoli, da se mu ljudje čustveno preveč približajo, je navezal neomajno vez z Georgom, izjemno inteligentnim odraslim goriljim samcem, za katerega skrbi že od njegovega rojstva. Toda ko gre po zlu neuradni genetski poskus, se ta nežna opica nenadoma prelevi v gromozansko besnečo zver. In - kar je še huje - kmalu postane jasno, da so podobno preobražene tudi nekatere druge živali. Ti na novo ustvarjeni alfa plenilci sejejo grozo po Severni Ameriki in uničujejo vse, kar se jim znajde na poti. Okoye poišče pomoč genetskega inženirja, ki se je znašel na slabem glasu, da najdeta cepivo, pri tem pa se prebija skozi bojišče, na katerem je vsak hip drugačno stanje; ustaviti mora ne le katastrofo globalnih razsežnosti, temveč tudi rešiti bitje, ki je bil nekoč njegov prijatelj.