Un pouvoir mystérieux transporte Gintoki dans un avenir où il n'existe pas. Il se retrouve là dans les rues d'une Edo en ruine. Les seuls gens étant restés sur la Terre désolée sont les pauvres, les Jouishishi qui tentent d'anéantir le gouvernement, les voyous qui profitent du relâchement de la loi, et ceux qui ont obstinément refusé de fuir alors que la fin approchait. Alors qu'il erre, Gintoki rencontre deux jeunes gens. Un jeune homme à lunettes portant un sabre de bois marqué « Lac Touya », réglant son compte à une bande de voyous, puis une jeune femme portant des habits chinois aux mêmes motifs que les siens, accompagnée d'un chien gigantesque : ce sont Shinpachi et Kagura devenus adultes. Il découvre alors petit à petit cet avenir radicalement différent ainsi que la choquante vérité.

Jeune lycéen, Hodaka fuit son île pour rejoindre Tokyo. Sans argent ni emploi, il tente de survivre dans la jungle urbaine et trouve un poste dans une revue dédiée au paranormal. Un phénomène météorologique extrême touche alors le Japon, exposé à de constantes pluies. Hodaka est dépêché pour enquêter sur l'existence de prêtresses du temps. Peu convaincu par cette légende, il change soudainement d'avis lorsqu'il croise la jeune Hina…

Nous sommes en l’an 2035. Les quelques milliers d’habitants qui restent sur notre planète sont contraints de vivre sous terre. La surface du globe est devenue inhabitable à la suite d’un virus ayant décimé 99 % de la population. Les survivants mettent tous leurs espoirs dans un voyage à travers le temps pour découvrir les causes de la catastrophe et la prévenir. C’est James Cole, hanté depuis des années par une image incompréhensible, qui est désigné pour cette mission.

A quelques jours de Noël, Isabella Everhart, surnommée "Belle", est envoyée par son père, Rex, dans un magnifique domaine pour procéder à l’inventaire et l’estimation de tous les biens destinés à la vente qui doit impérativement avoir lieu avant le 25 décembre. Hunter Lowell, le propriétaire des lieux, lui réserve un accueil glacial. En effet, le riche héritier, hanté par de douloureux souvenirs, est taciturne et se laisse parfois emporté par la colère. En revanche, son chien appelé "La bête", réputé pour être grognon, se montre soudain doux et câlin au contact de la jeune femme...

Midori Saejima retourne au lycée après avoir été malade et a hâte de retrouver le garçon dont elle est tombée amoureuse. Seulement, pendant son absence, ses camarades de classe l'ont inscrite comme candidate du comité des élèves et devant leurs enthousiasmes Midori n'a pas eu d'autres choix que d'accepter. Mais son discours de présentation devait être prêt cette après-midi même, n'étant pas préparé elle se retrouva stresser sur scène et se demande ce qu'elle allait dire; elle qui ne voulait voir que son amoureux... C'est alors qu'elle l'aperçut, lui aussi participer à l'élection !